肾透明细胞癌差异表达基因的筛选及其核心基因相应miRNA和lncRNA 预测分析
【目的】筛选肾透明细胞癌（ccRCC）中差异表达基因并其相关miRNA和lncRNA，寻找可作为ccRCC诊断及治疗的生物标志物。【方法】通过从TCGA数据库和GEO数据库筛选ccRCC差异表达基因并取交集，对差异表达基因进行GO功能分析和KEGG通路富集分析，使用MCODE软件筛选出差异表达基因中的核心基因，并利用mirDIP 数据库和STARBASE 数据库对核心基因上游的miRNA 和lncRNA 进行预测。【结果】共筛选出427个差异表达基因，这些差异表达基因在GO功能分析上主要与催化活性、受体活性和细胞黏附分子活性等功能相关，KEGG 信号通路富集结果则表明其主要与PPAR、Rap1...
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| Main Authors: | , , , , , |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | zho |
| Published: |
Editorial Office of Journal of Sun Yat-sen University
2018-01-01
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| Series: | Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban |
| Subjects: | |
| Online Access: | http://xuebaoyx.sysu.edu.cn/zh/article/43567347/ |
| Tags: |
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