基于Illumina 高通量测序的马来熊（Helarctos malayanus）粪便菌群多样性初探
应用新一代高通量测序技术Illumina Miseq对上海动物园3只马来熊的12个粪便样本中的菌群结构及其多样性进行检测和分析。样中共检测到884522条序列，共检测到15个菌门，主要有7个优势菌门，按照多样性高低依次是：厚壁菌门（Firmicutes）（54.70%）、变形菌门（Proteobacteria）（41.90%）、梭杆菌门（Fusobacteria）（1.80%）、蓝藻菌门（Cyanobacteria）（0.70%）、放线菌门（Actinobacteria）（0.20%）、拟杆菌门（Bacteroidetes）和未定门（TM7）。粪便样本中能够确定到菌属的序列占73.10%，以链...
Saved in:
| Main Author: | |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | zho |
| Published: |
Editorial Department of Chinese Journal of Wildlife
2019-01-01
|
| Series: | 野生动物学报 |
| Subjects: | |
| Online Access: | http://ysdw.nefu.edu.cn/thesisDetails?columnId=67057675&Fpath=home&index=0 |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| _version_ | 1841542225729683456 |
|---|---|
| author | 袁耀华刘群秀裴恩乐 |
| author_facet | 袁耀华刘群秀裴恩乐 |
| author_sort | 袁耀华刘群秀裴恩乐 |
| collection | DOAJ |
| description | 应用新一代高通量测序技术Illumina Miseq对上海动物园3只马来熊的12个粪便样本中的菌群结构及其多样性进行检测和分析。样中共检测到884522条序列，共检测到15个菌门，主要有7个优势菌门，按照多样性高低依次是：厚壁菌门（Firmicutes）（54.70%）、变形菌门（Proteobacteria）（41.90%）、梭杆菌门（Fusobacteria）（1.80%）、蓝藻菌门（Cyanobacteria）（0.70%）、放线菌门（Actinobacteria）（0.20%）、拟杆菌门（Bacteroidetes）和未定门（TM7）。粪便样本中能够确定到菌属的序列占73.10%，以链球菌属（Streptococcus），大肠杆菌/志贺菌属（Escherichia-Shigella）和梭状杆菌属（Clostridium）为优势菌属。3只马来熊粪便菌群多样性比较：LS02粪便菌群多样性最高，其次是LS01，和LS03。结论：马来熊粪便菌群存在个体差异，但同一个体的优势菌群组成非常相似，年龄和性别可能会对马来熊粪便菌群产生影响。 |
| format | Article |
| id | doaj-art-57d15d39d0b54ba59aadd122991c0a49 |
| institution | Kabale University |
| issn | 2310-1490 |
| language | zho |
| publishDate | 2019-01-01 |
| publisher | Editorial Department of Chinese Journal of Wildlife |
| record_format | Article |
| series | 野生动物学报 |
| spelling | doaj-art-57d15d39d0b54ba59aadd122991c0a492025-01-14T04:16:41ZzhoEditorial Department of Chinese Journal of Wildlife野生动物学报2310-14902019-01-0188288967057675基于Illumina 高通量测序的马来熊（Helarctos malayanus）粪便菌群多样性初探袁耀华刘群秀裴恩乐应用新一代高通量测序技术Illumina Miseq对上海动物园3只马来熊的12个粪便样本中的菌群结构及其多样性进行检测和分析。样中共检测到884522条序列，共检测到15个菌门，主要有7个优势菌门，按照多样性高低依次是：厚壁菌门（Firmicutes）（54.70%）、变形菌门（Proteobacteria）（41.90%）、梭杆菌门（Fusobacteria）（1.80%）、蓝藻菌门（Cyanobacteria）（0.70%）、放线菌门（Actinobacteria）（0.20%）、拟杆菌门（Bacteroidetes）和未定门（TM7）。粪便样本中能够确定到菌属的序列占73.10%，以链球菌属（Streptococcus），大肠杆菌/志贺菌属（Escherichia-Shigella）和梭状杆菌属（Clostridium）为优势菌属。3只马来熊粪便菌群多样性比较：LS02粪便菌群多样性最高，其次是LS01，和LS03。结论：马来熊粪便菌群存在个体差异，但同一个体的优势菌群组成非常相似，年龄和性别可能会对马来熊粪便菌群产生影响。http://ysdw.nefu.edu.cn/thesisDetails?columnId=67057675&Fpath=home&index=0马来熊粪便菌群Illumina测序Miseq |
| spellingShingle | 袁耀华刘群秀裴恩乐 基于Illumina 高通量测序的马来熊（Helarctos malayanus）粪便菌群多样性初探 野生动物学报 马来熊 粪便菌群 Illumina测序 Miseq |
| title | 基于Illumina 高通量测序的马来熊（Helarctos malayanus）粪便菌群多样性初探 |
| title_full | 基于Illumina 高通量测序的马来熊（Helarctos malayanus）粪便菌群多样性初探 |
| title_fullStr | 基于Illumina 高通量测序的马来熊（Helarctos malayanus）粪便菌群多样性初探 |
| title_full_unstemmed | 基于Illumina 高通量测序的马来熊（Helarctos malayanus）粪便菌群多样性初探 |
| title_short | 基于Illumina 高通量测序的马来熊（Helarctos malayanus）粪便菌群多样性初探 |
| title_sort | 基于illumina 高通量测序的马来熊 helarctos malayanus 粪便菌群多样性初探 |
| topic | 马来熊 粪便菌群 Illumina测序 Miseq |
| url | http://ysdw.nefu.edu.cn/thesisDetails?columnId=67057675&Fpath=home&index=0 |
| work_keys_str_mv | AT yuányàohuáliúqúnxiùpéiēnlè jīyúilluminagāotōngliàngcèxùdemǎláixiónghelarctosmalayanusfènbiànjūnqúnduōyàngxìngchūtàn |