圈养梅花鹿肠道菌群组成的性别差异

圈养梅花鹿肠道菌群组成的性别差异

为探究圈养梅花鹿（<italic>Cervus nippon</italic>）肠道菌群的结构、多样性以及肠道菌群组成的性别差异，利用Illumina MiSeq高通量测序平台对10只圈养健康梅花鹿粪便中的细菌16S rRNA V3—V4区扩增子进行PCR扩增，采用生物信息学手段以性别作为分组因素，分析雄、雌圈养梅花鹿肠道菌群的结构、多样性和差异物种。结果显示：在门水平上，圈养梅花鹿肠道菌群的优势菌门为厚壁菌门（Firmicutes；雄性61.69%，雌性58.23%）和拟杆菌门（Bacteroidetes；雄性27.40%，雌性31.19%）；在属水平上，优势菌属为拟...

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Main Authors: 史倍宁, 赵耀, 林子涵, 田佳欣, 孙嘉, 马雅雯, 刘振生, 滕丽微
Format: Article
Language:zho
Published: Editorial Department of Chinese Journal of Wildlife 2023-05-01
Series:野生动物学报
Subjects:
肠道菌群
梅花鹿
圈养
性别
Online Access:http://ysdw.nefu.edu.cn/thesisDetails#10.12375/ysdwxb.20230212
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Description
Summary:为探究圈养梅花鹿（<italic>Cervus nippon</italic>）肠道菌群的结构、多样性以及肠道菌群组成的性别差异，利用Illumina MiSeq高通量测序平台对10只圈养健康梅花鹿粪便中的细菌16S rRNA V3—V4区扩增子进行PCR扩增，采用生物信息学手段以性别作为分组因素，分析雄、雌圈养梅花鹿肠道菌群的结构、多样性和差异物种。结果显示：在门水平上，圈养梅花鹿肠道菌群的优势菌门为厚壁菌门（Firmicutes；雄性61.69%，雌性58.23%）和拟杆菌门（Bacteroidetes；雄性27.40%，雌性31.19%）；在属水平上，优势菌属为拟杆菌属（<italic>Bacteroides</italic>；雄性4.60%，雌性6.13%）和梭菌属（<italic>Clostridium_IV</italic>； 雄性3.42%，雌性3.25%）。雄、雌圈养梅花鹿肠道菌群的<italic>α</italic>多样性无显著差异 （<italic>p</italic>&gt;0.05）。<italic>β</italic>多样性分析表明，不同性别梅花鹿的肠道菌群组成相似度较高，且组间不存在显著差异（<italic>p</italic>&gt;0.05）。STAMP和LEfSe分析表明，雌性圈养梅花鹿中起重要作用的菌群为拟杆菌门（LDA值&gt;4，<italic>p&lt;</italic>0.05）。研究表明，圈养梅花鹿肠道菌群结构及多样性性别间无显著差异，但雄、雌梅花鹿肠道中个别菌门、菌属的分布存在一定差异，拟杆菌门受宿主性别影响较大。
ISSN:2310-1490

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