食管鳞癌患者唾液菌群的研究

【目的】分析食管鳞癌患者(ESCC组)与健康对照组(HC组)唾液菌群多样性,筛选出食管鳞癌患者唾液中特异性细菌。【方法】收集50例食管鳞癌患者和40例健康对照者的唾液标本,提取总DNA,用PCR扩增16SrDNAV4区,进行高通量测序,将测序数据进行OUT聚类,物种注释及多样性分析。【结果】多样性分析表明ESCC组和HC组整体唾液菌群的多样性及组成方面存在差异(但>0.05),物种分析表明ESCC组以奈瑟菌属(Neisseria)、梭杆菌属(Fusobacterium)、嗜血杆菌属(Haemophilus)、普式菌属(Prevotella)、卟啉单胞菌属(Porphyromonas)为主...

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Main Authors: 位俊敏, 李锐锋, 杨冬阳, 赖晓嵘, 刘婉薇, 蔡先彬, 贲晓松, 李子俊
Format: Article
Language:zho
Published: Editorial Office of Journal of Sun Yat-sen University 2020-01-01
Series:Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban
Subjects:
Online Access:http://xuebaoyx.sysu.edu.cn/zh/article/44095453/
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institution Kabale University
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spelling doaj-art-1f5d7dfb037d441a97b7ec1a78fe13c22025-01-15T02:36:06ZzhoEditorial Office of Journal of Sun Yat-sen UniversityZhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban1672-35542020-01-014144095453食管鳞癌患者唾液菌群的研究位俊敏李锐锋杨冬阳赖晓嵘刘婉薇蔡先彬贲晓松李子俊【目的】分析食管鳞癌患者(ESCC组)与健康对照组(HC组)唾液菌群多样性,筛选出食管鳞癌患者唾液中特异性细菌。【方法】收集50例食管鳞癌患者和40例健康对照者的唾液标本,提取总DNA,用PCR扩增16SrDNAV4区,进行高通量测序,将测序数据进行OUT聚类,物种注释及多样性分析。【结果】多样性分析表明ESCC组和HC组整体唾液菌群的多样性及组成方面存在差异(但>0.05),物种分析表明ESCC组以奈瑟菌属(Neisseria)、梭杆菌属(Fusobacterium)、嗜血杆菌属(Haemophilus)、普式菌属(Prevotella)、卟啉单胞菌属(Porphyromonas)为主,健康对照组以奈瑟菌属(Neisseria)、嗜血杆菌属(Haemophilus)、普式菌属(Prevotella)、梭杆菌属(Fusobacterium)、韦荣氏球菌属(Veillonella)为主,LEfSe分析表明ESCC组卟啉菌属表达升高,且具有统计学差异(<0.05)。【结论】食管癌患者唾液有其特征性的菌群组成,与健康对照组相比,食管鳞癌患者唾液中卟啉菌属表达明显升高,是特征性表达的细菌。http://xuebaoyx.sysu.edu.cn/zh/article/44095453/食管鳞癌唾液细菌卟啉单胞菌属
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