基于高通量测序技术对不同季节圈养褐马鸡肠道菌群多样性分析

基于高通量测序技术对不同季节圈养褐马鸡肠道菌群多样性分析

为提高褐马鸡(<i>Crossoptilon mantchuricum</i>)疾病防控能力和饲养管理水平,利用高通量测序技术对其肠道菌群进行多样性分析,探知其肠道菌群在不同季节的变化规律,并预测潜在致病的高发时间段,结果表明:门水平上,圈养褐马鸡的肠道优势菌群为厚壁菌门(Firmicutes,52.11%)、拟杆菌门(Bacteroidetes,18.20%)、变形菌门(Proteobacteria,17.91%)和放线菌门(Actinobacteria,7.32%); 属水平上,<i>Rikenellaceae_RC</i>9<i>...

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Main Authors: 雷 英, 苏 凯, 王运盛, 李金邦, 张成林, 李 雁, 张丽霞, 朱云芸, 金修哲, 任倩俐, 刘金鹏, 普天春
Format: Article
Language:zho
Published: Editorial Department of Chinese Journal of Wildlife 2022-01-01
Series:野生动物学报
Subjects:
褐马鸡
肠道菌群
季节变化
Online Access:http://ysdw.nefu.edu.cn/thesisDetails#10.12375/ysdwxb.20220414
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Description
Summary:为提高褐马鸡(<i>Crossoptilon mantchuricum</i>)疾病防控能力和饲养管理水平,利用高通量测序技术对其肠道菌群进行多样性分析,探知其肠道菌群在不同季节的变化规律,并预测潜在致病的高发时间段,结果表明:门水平上,圈养褐马鸡的肠道优势菌群为厚壁菌门(Firmicutes,52.11%)、拟杆菌门(Bacteroidetes,18.20%)、变形菌门(Proteobacteria,17.91%)和放线菌门(Actinobacteria,7.32%); 属水平上,<i>Rikenellaceae_RC</i>9<i>_gut_group</i>为优势菌属(5.56%),其次是链球菌属(<i>Streptococcus</i>,5.47%)和脱硫弧菌属(<i>Desulfovibrio</i>,4.74%)。通过组间差异分析结合不同季节菌群变化规律,以春、夏、秋、冬四季依次排序,厚壁菌门呈递减趋势; 拟杆菌门在春季组和夏季组较低,在秋季组和冬季组呈递增趋势,冬季组丰度为36.72%; 变形菌门在夏季组丰度最高(34.81%),差异显著(<i>P</i><0.05); <i>Rikenellaceae_RC</i>9<i>_gut_group</i>最为优势,春季组至夏季组呈递减趋势,秋、冬组逐渐升高,冬季组达到峰值,差异显著(<i>P</i><0.05); 链球菌属在夏季呈爆发式增长(21.84%),其他各组均低于0.05%,同时,潜在致病性预测也发现夏季组患病风险明显增加。综上,不同季节圈养褐马鸡的肠道菌群会发生相应的改变,夏季则是褐马鸡消化道疾病高发季节。
ISSN:2310-1490

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