Differential expression of ABO in normal and tumor tissues: Implications for cancer biology and prognosis

الملخص: أهداف البحث: تعرف فصيلة ABO في المقام الأول بتحديد فصائل الدم، وأظهرت الدراسات أنماط تعبير متغيرة في الأنسجة المختلفة وأنواع السرطان. وتهدف هذه الدراسة البحث في العلاقة بين التعبير الجيني للفصيلة والسرطان، وتقييم تأثيره المحتمل على بقاء المريض على قيد الحياة. طرق البحث: باستخدام قاعدة بيانا...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Main Authors: Hind M. Albadrani, PhD, Munerah Hamed, PhD, Abeer Zakariyah, PhD, Samar Binkheder, PhD, Saeed M. Kabrah, PhD, Arwa F. Flemban, PhD
Format: Article
Language:English
Published: Elsevier 2024-12-01
Series:Journal of Taibah University Medical Sciences
Subjects:
Online Access:http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1658361224001513
Tags: Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
_version_ 1846116145531191296
author Hind M. Albadrani, PhD
Munerah Hamed, PhD
Abeer Zakariyah, PhD
Samar Binkheder, PhD
Saeed M. Kabrah, PhD
Arwa F. Flemban, PhD
author_facet Hind M. Albadrani, PhD
Munerah Hamed, PhD
Abeer Zakariyah, PhD
Samar Binkheder, PhD
Saeed M. Kabrah, PhD
Arwa F. Flemban, PhD
author_sort Hind M. Albadrani, PhD
collection DOAJ
description الملخص: أهداف البحث: تعرف فصيلة ABO في المقام الأول بتحديد فصائل الدم، وأظهرت الدراسات أنماط تعبير متغيرة في الأنسجة المختلفة وأنواع السرطان. وتهدف هذه الدراسة البحث في العلاقة بين التعبير الجيني للفصيلة والسرطان، وتقييم تأثيره المحتمل على بقاء المريض على قيد الحياة. طرق البحث: باستخدام قاعدة بيانات GEPIA، قمنا بتحليل تعبير ABO في الأنسجة الطبيعية والأورام عبر أنواع السرطان المختلفة باستخدام أدوات التحاليل الجينية المتاحة عبر الإنترنت لإجراء تقييم شامل. النتائج: كشف التحليل عن تباينات كبيرة في التعبير عن ABO بين أنواع الأنسجة المختلفة. والجدير بالذكر أن أنسجة المبيض والغدة الدرقية أظهرت أعلى تعبير عن ABO، في حين أظهرت أنسجة الكبد والغدة الصعترية والدماغ تعبيرًا منخفضًا نسبيًا. وتباينت أنماط التعبير عن ABO بشكل واضح بين أنواع السرطان، حيث أظهرت سرطانات المبيض والغدة الدرقية الاختلافات الأكثر أهمية بين أنسجة الورم والأنسجة الطبيعية. كما أظهرت أنواع أخرى من السرطان، بما في ذلك سرطان قشرة الكظر، وسرطان الدم النقوي الحاد، وسرطان الخلايا الكلوية، اختلافات ملحوظة في التعبير عن ABO. وارتبط انخفاض التعبير عن ABO بانخفاض معدلات البقاء على قيد الحياة في سرطان الغدة الدرقية القولون والمستقيم، وسرطان الغدة الدرقية في المعدة، وسرطانات الكلى، وغيرها. الاستنتاجات: تشير هذه النتائج إلى الدور المحتمل لـ ABO في تطور الورم وتطور السرطان والتشخيص. كما تؤكد هذه الدراسة على قيمة ABO كمؤشر حيوي لمختلف أنواع السرطان وتتطلب إجراء المزيد من البحث لفهم أدواره الوظيفية وتأثيراته العلاجية لتطوير علاجات السرطان المستهدفة وأدوات التشخيص. Abstract: Objectives: ABO, which is primarily recognized for determining blood types, shows variable expression patterns in different tissues and cancer types. This study investigated the relationship between gene expression and cancer, and assessed its potential impact on patient survival. Methods: Utilizing the GEPIA database, we analyzed ABO expression in normal and tumor tissues across various cancer types using online in silico tools for comprehensive evaluation. Results: The analysis revealed significant disparities in ABO expression among different tissue types. Notably, ovarian and thyroid tissues exhibited the highest expression of ABO, whereas the liver, thymus, and brain tissues showed relatively low expression. The expression patterns of ABO varied distinctly among cancer types, with ovarian and thyroid carcinomas demonstrating the most significant differences between tumor and normal tissues. Other cancers, including adrenocortical carcinoma, acute myeloid leukemia, and renal cell carcinoma, also exhibit notable variations in ABO expression. Low ABO expression was correlated with reduced survival rates in colorectal adenocarcinoma, stomach adenocarcinoma, and renal cancers, among others. Conclusions: These findings suggest the potential role of ABO in tumor development, as well as cancer progression and prognosis, underscoring the value of ABO as a biomarker for various cancers. This warrants further research for understanding the functional roles of ABO and its therapeutic implications to develop targeted cancer therapies and diagnostic tools.
format Article
id doaj-art-fe427fdb9d434aa5abd315e76beb0b51
institution Kabale University
issn 1658-3612
language English
publishDate 2024-12-01
publisher Elsevier
record_format Article
series Journal of Taibah University Medical Sciences
spelling doaj-art-fe427fdb9d434aa5abd315e76beb0b512024-12-19T10:53:00ZengElsevierJournal of Taibah University Medical Sciences1658-36122024-12-0119611321142Differential expression of ABO in normal and tumor tissues: Implications for cancer biology and prognosisHind M. Albadrani, PhD0Munerah Hamed, PhD1Abeer Zakariyah, PhD2Samar Binkheder, PhD3Saeed M. Kabrah, PhD4Arwa F. Flemban, PhD5Department of Clinical Laboratory Sciences, College of Applied Medical Sciences, Imam Abdulrahman Bin Faisal University, Dammam, Eastern Province, KSADepartment of Pathology, Faculty of Medicine, Umm Al-Qura University, Makkah, KSADepartment of Medical Genetics, Faculty of Medicine, University of Jeddah, Jeddah, KSAMedical Informatics Unit, Department of Medical Education, College of Medicine, King Saud University, Riyadh, KSADepartment of Clinical Laboratory Sciences, Faculty of Applied Medical Sciences, Umm Al-Qura University, KSA; Corresponding address: Department of Clinical Laboratory Sciences, Faculty of Applied Medical Sciences, Umm Al-Qura University, KSA.Department of Pathology, Faculty of Medicine, Umm Al-Qura University, Makkah, KSAالملخص: أهداف البحث: تعرف فصيلة ABO في المقام الأول بتحديد فصائل الدم، وأظهرت الدراسات أنماط تعبير متغيرة في الأنسجة المختلفة وأنواع السرطان. وتهدف هذه الدراسة البحث في العلاقة بين التعبير الجيني للفصيلة والسرطان، وتقييم تأثيره المحتمل على بقاء المريض على قيد الحياة. طرق البحث: باستخدام قاعدة بيانات GEPIA، قمنا بتحليل تعبير ABO في الأنسجة الطبيعية والأورام عبر أنواع السرطان المختلفة باستخدام أدوات التحاليل الجينية المتاحة عبر الإنترنت لإجراء تقييم شامل. النتائج: كشف التحليل عن تباينات كبيرة في التعبير عن ABO بين أنواع الأنسجة المختلفة. والجدير بالذكر أن أنسجة المبيض والغدة الدرقية أظهرت أعلى تعبير عن ABO، في حين أظهرت أنسجة الكبد والغدة الصعترية والدماغ تعبيرًا منخفضًا نسبيًا. وتباينت أنماط التعبير عن ABO بشكل واضح بين أنواع السرطان، حيث أظهرت سرطانات المبيض والغدة الدرقية الاختلافات الأكثر أهمية بين أنسجة الورم والأنسجة الطبيعية. كما أظهرت أنواع أخرى من السرطان، بما في ذلك سرطان قشرة الكظر، وسرطان الدم النقوي الحاد، وسرطان الخلايا الكلوية، اختلافات ملحوظة في التعبير عن ABO. وارتبط انخفاض التعبير عن ABO بانخفاض معدلات البقاء على قيد الحياة في سرطان الغدة الدرقية القولون والمستقيم، وسرطان الغدة الدرقية في المعدة، وسرطانات الكلى، وغيرها. الاستنتاجات: تشير هذه النتائج إلى الدور المحتمل لـ ABO في تطور الورم وتطور السرطان والتشخيص. كما تؤكد هذه الدراسة على قيمة ABO كمؤشر حيوي لمختلف أنواع السرطان وتتطلب إجراء المزيد من البحث لفهم أدواره الوظيفية وتأثيراته العلاجية لتطوير علاجات السرطان المستهدفة وأدوات التشخيص. Abstract: Objectives: ABO, which is primarily recognized for determining blood types, shows variable expression patterns in different tissues and cancer types. This study investigated the relationship between gene expression and cancer, and assessed its potential impact on patient survival. Methods: Utilizing the GEPIA database, we analyzed ABO expression in normal and tumor tissues across various cancer types using online in silico tools for comprehensive evaluation. Results: The analysis revealed significant disparities in ABO expression among different tissue types. Notably, ovarian and thyroid tissues exhibited the highest expression of ABO, whereas the liver, thymus, and brain tissues showed relatively low expression. The expression patterns of ABO varied distinctly among cancer types, with ovarian and thyroid carcinomas demonstrating the most significant differences between tumor and normal tissues. Other cancers, including adrenocortical carcinoma, acute myeloid leukemia, and renal cell carcinoma, also exhibit notable variations in ABO expression. Low ABO expression was correlated with reduced survival rates in colorectal adenocarcinoma, stomach adenocarcinoma, and renal cancers, among others. Conclusions: These findings suggest the potential role of ABO in tumor development, as well as cancer progression and prognosis, underscoring the value of ABO as a biomarker for various cancers. This warrants further research for understanding the functional roles of ABO and its therapeutic implications to develop targeted cancer therapies and diagnostic tools.http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1658361224001513ABOCancerGene expressionIn silico, tissueTumor
spellingShingle Hind M. Albadrani, PhD
Munerah Hamed, PhD
Abeer Zakariyah, PhD
Samar Binkheder, PhD
Saeed M. Kabrah, PhD
Arwa F. Flemban, PhD
Differential expression of ABO in normal and tumor tissues: Implications for cancer biology and prognosis
Journal of Taibah University Medical Sciences
ABO
Cancer
Gene expression
In silico, tissue
Tumor
title Differential expression of ABO in normal and tumor tissues: Implications for cancer biology and prognosis
title_full Differential expression of ABO in normal and tumor tissues: Implications for cancer biology and prognosis
title_fullStr Differential expression of ABO in normal and tumor tissues: Implications for cancer biology and prognosis
title_full_unstemmed Differential expression of ABO in normal and tumor tissues: Implications for cancer biology and prognosis
title_short Differential expression of ABO in normal and tumor tissues: Implications for cancer biology and prognosis
title_sort differential expression of abo in normal and tumor tissues implications for cancer biology and prognosis
topic ABO
Cancer
Gene expression
In silico, tissue
Tumor
url http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1658361224001513
work_keys_str_mv AT hindmalbadraniphd differentialexpressionofaboinnormalandtumortissuesimplicationsforcancerbiologyandprognosis
AT munerahhamedphd differentialexpressionofaboinnormalandtumortissuesimplicationsforcancerbiologyandprognosis
AT abeerzakariyahphd differentialexpressionofaboinnormalandtumortissuesimplicationsforcancerbiologyandprognosis
AT samarbinkhederphd differentialexpressionofaboinnormalandtumortissuesimplicationsforcancerbiologyandprognosis
AT saeedmkabrahphd differentialexpressionofaboinnormalandtumortissuesimplicationsforcancerbiologyandprognosis
AT arwafflembanphd differentialexpressionofaboinnormalandtumortissuesimplicationsforcancerbiologyandprognosis