虎皮鹦鹉全基因组中微卫星分布规律研究
对虎皮鹦鹉(<i>Melopsittacus undulatus</i>)全基因组中微卫星分布特征进行了分析,查找到l~6个碱基重复类型的微卫星序列共90 346个,约占整个基因组总长度的序列(1.1 Gb)的0.41%,分布频率为82.9/Mb。不同类型微卫星中,单碱基重复类型数目最多,为50 349个,占总数的55.7%; 其次是二、四、三、五、六碱基重复单元序列,分别占到总数的16.3%,13.7%,10.8%,2.9%,0.5%。单碱基微卫星中A重复类型数量最多,二碱基中AT最多,三碱基中AAT,四碱基中AAAC最多,五碱基中AAAGA最多,六碱基中AACCCT...
Saved in:
Main Author: | |
---|---|
Format: | Article |
Language: | zho |
Published: |
Editorial Department of Chinese Journal of Wildlife
2017-01-01
|
Series: | 野生动物学报 |
Subjects: | |
Online Access: | http://ysdw.nefu.edu.cn/thesisDetails?columnId=67065120&Fpath=home&index=0 |
Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
_version_ | 1841542184870871040 |
---|---|
author | 黄 杰 原宝东 杨承忠 |
author_facet | 黄 杰 原宝东 杨承忠 |
author_sort | 黄 杰 原宝东 杨承忠 |
collection | DOAJ |
description | 对虎皮鹦鹉(<i>Melopsittacus undulatus</i>)全基因组中微卫星分布特征进行了分析,查找到l~6个碱基重复类型的微卫星序列共90 346个,约占整个基因组总长度的序列(1.1 Gb)的0.41%,分布频率为82.9/Mb。不同类型微卫星中,单碱基重复类型数目最多,为50 349个,占总数的55.7%; 其次是二、四、三、五、六碱基重复单元序列,分别占到总数的16.3%,13.7%,10.8%,2.9%,0.5%。单碱基微卫星中A重复类型数量最多,二碱基中AT最多,三碱基中AAT,四碱基中AAAC最多,五碱基中AAAGA最多,六碱基中AACCCT最多。A、AT、C、AC、AAT、AAAC、AAAT、AGG、AGC、AG、AAAG、AAC、ATCC、AAGG、AGAT、ATC、AACC、ACC依次是虎皮鹦鹉基因组中分布数量最多的18种微卫星重复拷贝类型。本研究将为虎皮鹦鹉微卫星标记的分离筛选、遗传多样性的研究以及不同物种微卫星的比较分析奠定了基础。 |
format | Article |
id | doaj-art-f679b549b45e4b1d9236f0a60310ea98 |
institution | Kabale University |
issn | 2310-1490 |
language | zho |
publishDate | 2017-01-01 |
publisher | Editorial Department of Chinese Journal of Wildlife |
record_format | Article |
series | 野生动物学报 |
spelling | doaj-art-f679b549b45e4b1d9236f0a60310ea982025-01-14T04:18:30ZzhoEditorial Department of Chinese Journal of Wildlife野生动物学报2310-14902017-01-0142242667065120虎皮鹦鹉全基因组中微卫星分布规律研究黄 杰 原宝东 杨承忠对虎皮鹦鹉(<i>Melopsittacus undulatus</i>)全基因组中微卫星分布特征进行了分析,查找到l~6个碱基重复类型的微卫星序列共90 346个,约占整个基因组总长度的序列(1.1 Gb)的0.41%,分布频率为82.9/Mb。不同类型微卫星中,单碱基重复类型数目最多,为50 349个,占总数的55.7%; 其次是二、四、三、五、六碱基重复单元序列,分别占到总数的16.3%,13.7%,10.8%,2.9%,0.5%。单碱基微卫星中A重复类型数量最多,二碱基中AT最多,三碱基中AAT,四碱基中AAAC最多,五碱基中AAAGA最多,六碱基中AACCCT最多。A、AT、C、AC、AAT、AAAC、AAAT、AGG、AGC、AG、AAAG、AAC、ATCC、AAGG、AGAT、ATC、AACC、ACC依次是虎皮鹦鹉基因组中分布数量最多的18种微卫星重复拷贝类型。本研究将为虎皮鹦鹉微卫星标记的分离筛选、遗传多样性的研究以及不同物种微卫星的比较分析奠定了基础。http://ysdw.nefu.edu.cn/thesisDetails?columnId=67065120&Fpath=home&index=0虎皮鹦鹉基因组微卫星 |
spellingShingle | 黄 杰 原宝东 杨承忠 虎皮鹦鹉全基因组中微卫星分布规律研究 野生动物学报 虎皮鹦鹉 基因组 微卫星 |
title | 虎皮鹦鹉全基因组中微卫星分布规律研究 |
title_full | 虎皮鹦鹉全基因组中微卫星分布规律研究 |
title_fullStr | 虎皮鹦鹉全基因组中微卫星分布规律研究 |
title_full_unstemmed | 虎皮鹦鹉全基因组中微卫星分布规律研究 |
title_short | 虎皮鹦鹉全基因组中微卫星分布规律研究 |
title_sort | 虎皮鹦鹉全基因组中微卫星分布规律研究 |
topic | 虎皮鹦鹉 基因组 微卫星 |
url | http://ysdw.nefu.edu.cn/thesisDetails?columnId=67065120&Fpath=home&index=0 |
work_keys_str_mv | AT huángjiéyuánbǎodōngyángchéngzhōng hǔpíyīngwǔquánjīyīnzǔzhōngwēiwèixīngfēnbùguīlǜyánjiū |