普通鸬鹚基因组微卫星分布规律研究
本研究对普通鸬鹚全基因组微卫星分布规律进行分析,结果表明:普通鸬鹚基因组中微卫星总个数为135 498个,总长度为2 304 711 bp。6种重复类型中,单碱基重复数量最多,为102 005个,占重复类型总数目的75.3%,其次是四、二、三、五、六碱基重复类型,分别占到总数的7.8%、6.9%、6.5%、3.0%、0.5% 。不同的拷贝类型在微卫星中重复拷贝类别数量有所差别,单碱基微卫星中A重复类型数量最多,所占比例为96.67%,其次是二碱基中AC最多、三碱基AAT最多、四碱基AAAC最多,所占比例分别为55.39%、30.26%、30.74%。在普通鸬鹚基因组中微卫星数量最多的前16种重...
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Format: | Article |
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Published: |
Editorial Department of Chinese Journal of Wildlife
2020-01-01
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Series: | 野生动物学报 |
Subjects: | |
Online Access: | http://ysdw.nefu.edu.cn/thesisDetails?columnId=67058940&Fpath=home&index=0 |
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description | 本研究对普通鸬鹚全基因组微卫星分布规律进行分析,结果表明:普通鸬鹚基因组中微卫星总个数为135 498个,总长度为2 304 711 bp。6种重复类型中,单碱基重复数量最多,为102 005个,占重复类型总数目的75.3%,其次是四、二、三、五、六碱基重复类型,分别占到总数的7.8%、6.9%、6.5%、3.0%、0.5% 。不同的拷贝类型在微卫星中重复拷贝类别数量有所差别,单碱基微卫星中A重复类型数量最多,所占比例为96.67%,其次是二碱基中AC最多、三碱基AAT最多、四碱基AAAC最多,所占比例分别为55.39%、30.26%、30.74%。在普通鸬鹚基因组中微卫星数量最多的前16种重复拷贝类别依次为A、AC、C、AAAC、AAT、AT、AAAT、AAC、AG、AGG、AAAG、AAGG、ACC、ACG、AACC、AGC。本研究为以后普通鸬鹚微卫星的筛选、遗传结构分析、个体识别、遗传多样性分析等方面奠定了基础。 |
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institution | Kabale University |
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publisher | Editorial Department of Chinese Journal of Wildlife |
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