بررسی تاثیر چندشکلی‌های گیرنده هورمون لوتئینه‌کننده بر تمایل اتصال آنها به هورمون لوتئینه کننده در گاوشیری به روش داکینگ مولکولی
چکیدهسابقه و هدف: هورمون لوتئینه کننده (LH ) از جمله هورمون‌های مهم تولیدمثلی است که از لب پیشین هیپوفیز ترشح می‌شود و نقش کلیدی در تنظیم چرخه فحلی، بلوغ فولیکول‌های تخمدانی، تخمک‌ریزی، تشکیل جسم زرد، توسعه جسم زرد و نگهداری آن دارد. انتقال پیام LH از طریق اتصال آن به گیرنده‌های برون سلولی صورت می‌گ...
Saved in:
| Main Authors: | , , |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | fas |
| Published: |
Gorgan University of Agricultural Sciences and Natural Resources
2022-05-01
|
| Series: | پژوهش در نشخوارکنندگان |
| Subjects: | |
| Online Access: | https://ejrr.gau.ac.ir/article_5868_5d488c5ae27192d9f4e50d70748befca.pdf |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| _version_ | 1846148358993870848 |
|---|---|
| author | محمد یحیایی مهدی خدایی محمدحسین مرادی |
| author_facet | محمد یحیایی مهدی خدایی محمدحسین مرادی |
| author_sort | محمد یحیایی |
| collection | DOAJ |
| description | چکیدهسابقه و هدف: هورمون لوتئینه کننده (LH ) از جمله هورمون‌های مهم تولیدمثلی است که از لب پیشین هیپوفیز ترشح می‌شود و نقش کلیدی در تنظیم چرخه فحلی، بلوغ فولیکول‌های تخمدانی، تخمک‌ریزی، تشکیل جسم زرد، توسعه جسم زرد و نگهداری آن دارد. انتقال پیام LH از طریق اتصال آن به گیرنده‌های برون سلولی صورت می‌گیرد به طوریکه LH بعد از اتصال به گیرنده خود (LHR) از طریق فعال سازی پیامبر ثانویه cAMP منجر به فعال شدن زنجیره آبشاری درون سلولی و در نهایت بیان پروتئین‌ها و آنزیم‌های مخصوص می‌گردد. لذا برهمکنش هورمون لوتئینه کننده (LH) با گیرنده اختصاصی خود (LHR) یک از گام‌های کلیدی در مسیر بلوغ فولیکولی و تخمک‌گذاری آنها است. چندشکلی و ایزوفروم‌های مختلف LHR از جمله تغییرات ژنتیکی می‌باشند که می‌توانند بر روی عملکرد LH و متعاقبا بازدهی تولیدمثلی تاثیر گذار باشند. هدف از انجام مطالعه حاضر مقایسه چندشکلی‌های مختلف LHR از نظر ساختار سوم پروتئینی و تمایل برهمکنش آنها با LH در 'گاو شیری بود. مواد و روش‌ها: به منظور انجام مطالعه توالی‌های آمینواسیدی LHR از Genebank گرفته شد. در ابتدا چندشکلی‌ها با آنالیز هم ترازی شناسائی شدند. ساختارهای سوم مربوط به آنها با روش همولوژی مدلینگ و با استفاده از نرم افزار Modeller وپیش‌بینی گردید. ساختارهای ایجاد شده با استفاده از نرم افزار گرافیکی PyMol 2.5.1 و نمودار Ramachandran مورد مشاهده و ارزیابی قرار گرفتند. همچنین شاخص‌های مختلف فیزیکی-شیمیائی پروتئین‌های مدل شده مانند نقطه ایزوالکتریک، وزن مولکولی، تعداد دنباله‌های منفی و مثبت و مقدار Grand Average of hydropathicity (GRAVY) با استفاده از ابزار ProtParam در پایگاه Expasy محاسبه گردید. در ادامه میزان تمایل LH به هر کدام از چندشکلی‌های LHR با استفاده از تکنیک داکینگ مولکولی و بر پایه دو شاخص موقعیت فضائی و انرژی اتصال مورد ارزیابی قرار گرفت.یافته‌ها: براساس نتایج بدست آمده تنها دو چندشکلی (LHR1 و LHR2) در میان توالی‌های مورد مطالعه شناسائی شد. مدل‌های ایجاد شده برای دو چندشکلی یافت شده از کیفیت مناسبی برخوردار بودند و تفاوتی در شاخص‌های ساختاری و فیزیکوشیمیائی بین آنها مشاهده نشد. نتایج داکینگ نشان داد علی‌رغم تفاوت انرژی اتصال کل در دو چندشکلی، این تفاوت را نمی‌توان به جایگزینی آمینواسیدی ارتباط داد و احتمالا این اختلاف مرتبط با تفاوت جزئی در جهت‌گیری LH نسبت به چندشکلی‌های LHR1 و LHR2 می‌باشد. بخش زیادی از آمینواسیدهای درگیر در پیوند هیدروژنی در هر دو کمپلکس LH-LHR1 و LH-LHR2 مشابه بودند. نتیجه‌گیری: به طور کلی نتایج حاصل از این مطالعه می‌تواند نقش موثری در درک رابطه چندشکلی و فعالیت فیزیولوژیک داشته باشد. واژه‌های کلیدی: چندشکلی، LHR، آمینواسید، داکینگ مولکولی، گاوشیری |
| format | Article |
| id | doaj-art-f2a6b82e322e45d798621ff2fc65ee71 |
| institution | Kabale University |
| issn | 2345-4253 2345-4261 |
| language | fas |
| publishDate | 2022-05-01 |
| publisher | Gorgan University of Agricultural Sciences and Natural Resources |
| record_format | Article |
| series | پژوهش در نشخوارکنندگان |
| spelling | doaj-art-f2a6b82e322e45d798621ff2fc65ee712024-12-01T08:39:32ZfasGorgan University of Agricultural Sciences and Natural Resourcesپژوهش در نشخوارکنندگان2345-42532345-42612022-05-01101354810.22069/ejrr.2022.19569.18085868بررسی تاثیر چندشکلی‌های گیرنده هورمون لوتئینه‌کننده بر تمایل اتصال آنها به هورمون لوتئینه کننده در گاوشیری به روش داکینگ مولکولیمحمد یحیایی0مهدی خدایی1محمدحسین مرادی2ایران، اراک، دانشگاه اراک، دانشکده کشاورزی و محیط زیست، گروه علوم دامیدانشیار ، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه اراکدانشیار، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه اراکچکیدهسابقه و هدف: هورمون لوتئینه کننده (LH ) از جمله هورمون‌های مهم تولیدمثلی است که از لب پیشین هیپوفیز ترشح می‌شود و نقش کلیدی در تنظیم چرخه فحلی، بلوغ فولیکول‌های تخمدانی، تخمک‌ریزی، تشکیل جسم زرد، توسعه جسم زرد و نگهداری آن دارد. انتقال پیام LH از طریق اتصال آن به گیرنده‌های برون سلولی صورت می‌گیرد به طوریکه LH بعد از اتصال به گیرنده خود (LHR) از طریق فعال سازی پیامبر ثانویه cAMP منجر به فعال شدن زنجیره آبشاری درون سلولی و در نهایت بیان پروتئین‌ها و آنزیم‌های مخصوص می‌گردد. لذا برهمکنش هورمون لوتئینه کننده (LH) با گیرنده اختصاصی خود (LHR) یک از گام‌های کلیدی در مسیر بلوغ فولیکولی و تخمک‌گذاری آنها است. چندشکلی و ایزوفروم‌های مختلف LHR از جمله تغییرات ژنتیکی می‌باشند که می‌توانند بر روی عملکرد LH و متعاقبا بازدهی تولیدمثلی تاثیر گذار باشند. هدف از انجام مطالعه حاضر مقایسه چندشکلی‌های مختلف LHR از نظر ساختار سوم پروتئینی و تمایل برهمکنش آنها با LH در 'گاو شیری بود. مواد و روش‌ها: به منظور انجام مطالعه توالی‌های آمینواسیدی LHR از Genebank گرفته شد. در ابتدا چندشکلی‌ها با آنالیز هم ترازی شناسائی شدند. ساختارهای سوم مربوط به آنها با روش همولوژی مدلینگ و با استفاده از نرم افزار Modeller وپیش‌بینی گردید. ساختارهای ایجاد شده با استفاده از نرم افزار گرافیکی PyMol 2.5.1 و نمودار Ramachandran مورد مشاهده و ارزیابی قرار گرفتند. همچنین شاخص‌های مختلف فیزیکی-شیمیائی پروتئین‌های مدل شده مانند نقطه ایزوالکتریک، وزن مولکولی، تعداد دنباله‌های منفی و مثبت و مقدار Grand Average of hydropathicity (GRAVY) با استفاده از ابزار ProtParam در پایگاه Expasy محاسبه گردید. در ادامه میزان تمایل LH به هر کدام از چندشکلی‌های LHR با استفاده از تکنیک داکینگ مولکولی و بر پایه دو شاخص موقعیت فضائی و انرژی اتصال مورد ارزیابی قرار گرفت.یافته‌ها: براساس نتایج بدست آمده تنها دو چندشکلی (LHR1 و LHR2) در میان توالی‌های مورد مطالعه شناسائی شد. مدل‌های ایجاد شده برای دو چندشکلی یافت شده از کیفیت مناسبی برخوردار بودند و تفاوتی در شاخص‌های ساختاری و فیزیکوشیمیائی بین آنها مشاهده نشد. نتایج داکینگ نشان داد علی‌رغم تفاوت انرژی اتصال کل در دو چندشکلی، این تفاوت را نمی‌توان به جایگزینی آمینواسیدی ارتباط داد و احتمالا این اختلاف مرتبط با تفاوت جزئی در جهت‌گیری LH نسبت به چندشکلی‌های LHR1 و LHR2 می‌باشد. بخش زیادی از آمینواسیدهای درگیر در پیوند هیدروژنی در هر دو کمپلکس LH-LHR1 و LH-LHR2 مشابه بودند. نتیجه‌گیری: به طور کلی نتایج حاصل از این مطالعه می‌تواند نقش موثری در درک رابطه چندشکلی و فعالیت فیزیولوژیک داشته باشد. واژه‌های کلیدی: چندشکلی، LHR، آمینواسید، داکینگ مولکولی، گاوشیریhttps://ejrr.gau.ac.ir/article_5868_5d488c5ae27192d9f4e50d70748befca.pdfواژه‌های کلیدی: اسیدآمینهچندشکلیداکینگ مولکولیگیرنده هورمون لوتئینه کنندهگاوشیری |
| spellingShingle | محمد یحیایی مهدی خدایی محمدحسین مرادی بررسی تاثیر چندشکلی‌های گیرنده هورمون لوتئینه‌کننده بر تمایل اتصال آنها به هورمون لوتئینه کننده در گاوشیری به روش داکینگ مولکولی پژوهش در نشخوارکنندگان واژه‌های کلیدی: اسیدآمینه چندشکلی داکینگ مولکولی گیرنده هورمون لوتئینه کننده گاوشیری |
| title | بررسی تاثیر چندشکلی‌های گیرنده هورمون لوتئینه‌کننده بر تمایل اتصال آنها به هورمون لوتئینه کننده در گاوشیری به روش داکینگ مولکولی |
| title_full | بررسی تاثیر چندشکلی‌های گیرنده هورمون لوتئینه‌کننده بر تمایل اتصال آنها به هورمون لوتئینه کننده در گاوشیری به روش داکینگ مولکولی |
| title_fullStr | بررسی تاثیر چندشکلی‌های گیرنده هورمون لوتئینه‌کننده بر تمایل اتصال آنها به هورمون لوتئینه کننده در گاوشیری به روش داکینگ مولکولی |
| title_full_unstemmed | بررسی تاثیر چندشکلی‌های گیرنده هورمون لوتئینه‌کننده بر تمایل اتصال آنها به هورمون لوتئینه کننده در گاوشیری به روش داکینگ مولکولی |
| title_short | بررسی تاثیر چندشکلی‌های گیرنده هورمون لوتئینه‌کننده بر تمایل اتصال آنها به هورمون لوتئینه کننده در گاوشیری به روش داکینگ مولکولی |
| title_sort | بررسی تاثیر چندشکلی‌های گیرنده هورمون لوتئینه‌کننده بر تمایل اتصال آنها به هورمون لوتئینه کننده در گاوشیری به روش داکینگ مولکولی |
| topic | واژه‌های کلیدی: اسیدآمینه چندشکلی داکینگ مولکولی گیرنده هورمون لوتئینه کننده گاوشیری |
| url | https://ejrr.gau.ac.ir/article_5868_5d488c5ae27192d9f4e50d70748befca.pdf |
| work_keys_str_mv | AT mḥmdyḥyạyy brrsytạtẖyrcẖndsẖḵlyhạygyrndhhwrmwnlwtỷynhḵnndhbrtmạylạtṣạlậnhạbhhwrmwnlwtỷynhḵnndhdrgạwsẖyrybhrwsẖdạḵyngmwlḵwly AT mhdykẖdạyy brrsytạtẖyrcẖndsẖḵlyhạygyrndhhwrmwnlwtỷynhḵnndhbrtmạylạtṣạlậnhạbhhwrmwnlwtỷynhḵnndhdrgạwsẖyrybhrwsẖdạḵyngmwlḵwly AT mḥmdḥsynmrạdy brrsytạtẖyrcẖndsẖḵlyhạygyrndhhwrmwnlwtỷynhḵnndhbrtmạylạtṣạlậnhạbhhwrmwnlwtỷynhḵnndhdrgạwsẖyrybhrwsẖdạḵyngmwlḵwly |