基于宏基因组学的江西桃红岭梅花鹿潜在病原初步调查
近些年，江西桃红岭梅花鹿国家级自然保护区植被正向演替明显，大量梅花鹿（<italic>Cervus nippon</italic>）开始向保护区外围扩散和聚集，调查桃红岭梅花鹿潜在病原携带情况，有利于掌握其种群健康状况，进而制定精确的保护管理对策，因此在该保护区不同区域（核心区、缓冲区和实验区）采集梅花鹿新鲜粪便样品，并基于宏基因组测序技术分析其病原携带情况。结果表明：桃红岭梅花鹿携带病原微生物包括细菌、真菌、放线菌、支原体、衣原体和螺旋体，共34属63种，其中包含大量人兽共患病病原；病原丰度最高的5个属分别是拟梭菌属（<italic>Clostridioi...
Saved in:
| Main Authors: | , , , , , , |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | zho |
| Published: |
Editorial Department of Chinese Journal of Wildlife
2024-08-01
|
| Series: | 野生动物学报 |
| Subjects: | |
| Online Access: | http://ysdw.nefu.edu.cn/thesisDetails#10.12375/ysdwxb.20240306 |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| _version_ | 1841541948042641408 |
|---|---|
| author | 陈璐瑶 黄晓凤 张壹萱 詹建文 刘武华 刘小洪 张阳 |
| author_facet | 陈璐瑶 黄晓凤 张壹萱 詹建文 刘武华 刘小洪 张阳 |
| author_sort | 陈璐瑶 |
| collection | DOAJ |
| description | 近些年，江西桃红岭梅花鹿国家级自然保护区植被正向演替明显，大量梅花鹿（<italic>Cervus nippon</italic>）开始向保护区外围扩散和聚集，调查桃红岭梅花鹿潜在病原携带情况，有利于掌握其种群健康状况，进而制定精确的保护管理对策，因此在该保护区不同区域（核心区、缓冲区和实验区）采集梅花鹿新鲜粪便样品，并基于宏基因组测序技术分析其病原携带情况。结果表明：桃红岭梅花鹿携带病原微生物包括细菌、真菌、放线菌、支原体、衣原体和螺旋体，共34属63种，其中包含大量人兽共患病病原；病原丰度最高的5个属分别是拟梭菌属（<italic>Clostridioides</italic>）、李斯特菌属（<italic>Listeria</italic>）、克雷伯氏菌属（<italic>Klebsiella</italic>）、志贺氏菌属（<italic>Shigella</italic>）和沙门氏菌属（<italic>Salmonella</italic>），丰度最高的 5个种分别是艰难拟梭菌（<italic>Clostridioides difficile</italic>）、单核增生李斯特氏菌（<italic>Listeria monocytogenes</italic>）、肺炎克雷伯氏菌（<italic>Klebsiella pneumoniae</italic>）、肠炎沙门氏菌（<italic>Salmonella enteritidis</italic>）和福氏志贺氏菌（<italic>Shigella flexneri</italic>）；不同研究区域中，核心区梅花鹿携带病原数量显著低于缓冲区和实验区。以上结果表明，桃红岭梅花鹿携带有多种病原，存在一定疫病发生风险。建议在保护区核心区积极开展栖息地矮化工作，同时开展高危病原的持续性监测及预警，并加强对保护区外围扩散梅花鹿种群的保护管理。 |
| format | Article |
| id | doaj-art-ed2327ca3af241be84062143752b6e9b |
| institution | Kabale University |
| issn | 2310-1490 |
| language | zho |
| publishDate | 2024-08-01 |
| publisher | Editorial Department of Chinese Journal of Wildlife |
| record_format | Article |
| series | 野生动物学报 |
| spelling | doaj-art-ed2327ca3af241be84062143752b6e9b2025-01-14T04:22:26ZzhoEditorial Department of Chinese Journal of Wildlife野生动物学报2310-14902024-08-014550451267406370基于宏基因组学的江西桃红岭梅花鹿潜在病原初步调查陈璐瑶黄晓凤张壹萱詹建文刘武华刘小洪张阳近些年，江西桃红岭梅花鹿国家级自然保护区植被正向演替明显，大量梅花鹿（<italic>Cervus nippon</italic>）开始向保护区外围扩散和聚集，调查桃红岭梅花鹿潜在病原携带情况，有利于掌握其种群健康状况，进而制定精确的保护管理对策，因此在该保护区不同区域（核心区、缓冲区和实验区）采集梅花鹿新鲜粪便样品，并基于宏基因组测序技术分析其病原携带情况。结果表明：桃红岭梅花鹿携带病原微生物包括细菌、真菌、放线菌、支原体、衣原体和螺旋体，共34属63种，其中包含大量人兽共患病病原；病原丰度最高的5个属分别是拟梭菌属（<italic>Clostridioides</italic>）、李斯特菌属（<italic>Listeria</italic>）、克雷伯氏菌属（<italic>Klebsiella</italic>）、志贺氏菌属（<italic>Shigella</italic>）和沙门氏菌属（<italic>Salmonella</italic>），丰度最高的 5个种分别是艰难拟梭菌（<italic>Clostridioides difficile</italic>）、单核增生李斯特氏菌（<italic>Listeria monocytogenes</italic>）、肺炎克雷伯氏菌（<italic>Klebsiella pneumoniae</italic>）、肠炎沙门氏菌（<italic>Salmonella enteritidis</italic>）和福氏志贺氏菌（<italic>Shigella flexneri</italic>）；不同研究区域中，核心区梅花鹿携带病原数量显著低于缓冲区和实验区。以上结果表明，桃红岭梅花鹿携带有多种病原，存在一定疫病发生风险。建议在保护区核心区积极开展栖息地矮化工作，同时开展高危病原的持续性监测及预警，并加强对保护区外围扩散梅花鹿种群的保护管理。http://ysdw.nefu.edu.cn/thesisDetails#10.12375/ysdwxb.20240306梅花鹿江西桃红岭梅花鹿国家级自然保护区宏基因组测序病原微生物 |
| spellingShingle | 陈璐瑶 黄晓凤 张壹萱 詹建文 刘武华 刘小洪 张阳 基于宏基因组学的江西桃红岭梅花鹿潜在病原初步调查 野生动物学报 梅花鹿 江西桃红岭梅花鹿国家级自然保护区 宏基因组测序 病原微生物 |
| title | 基于宏基因组学的江西桃红岭梅花鹿潜在病原初步调查 |
| title_full | 基于宏基因组学的江西桃红岭梅花鹿潜在病原初步调查 |
| title_fullStr | 基于宏基因组学的江西桃红岭梅花鹿潜在病原初步调查 |
| title_full_unstemmed | 基于宏基因组学的江西桃红岭梅花鹿潜在病原初步调查 |
| title_short | 基于宏基因组学的江西桃红岭梅花鹿潜在病原初步调查 |
| title_sort | 基于宏基因组学的江西桃红岭梅花鹿潜在病原初步调查 |
| topic | 梅花鹿 江西桃红岭梅花鹿国家级自然保护区 宏基因组测序 病原微生物 |
| url | http://ysdw.nefu.edu.cn/thesisDetails#10.12375/ysdwxb.20240306 |
| work_keys_str_mv | AT chénlùyáo jīyúhóngjīyīnzǔxuédejiāngxītáohónglǐngméihuālùqiánzàibìngyuánchūbùdiàochá AT huángxiǎofèng jīyúhóngjīyīnzǔxuédejiāngxītáohónglǐngméihuālùqiánzàibìngyuánchūbùdiàochá AT zhāngyīxuān jīyúhóngjīyīnzǔxuédejiāngxītáohónglǐngméihuālùqiánzàibìngyuánchūbùdiàochá AT zhānjiànwén jīyúhóngjīyīnzǔxuédejiāngxītáohónglǐngméihuālùqiánzàibìngyuánchūbùdiàochá AT liúwǔhuá jīyúhóngjīyīnzǔxuédejiāngxītáohónglǐngméihuālùqiánzàibìngyuánchūbùdiàochá AT liúxiǎohóng jīyúhóngjīyīnzǔxuédejiāngxītáohónglǐngméihuālùqiánzàibìngyuánchūbùdiàochá AT zhāngyáng jīyúhóngjīyīnzǔxuédejiāngxītáohónglǐngméihuālùqiánzàibìngyuánchūbùdiàochá |