DNA损伤修复基因<italic>FANCI</italic>与肝癌预后和免疫浸润相关性
目的探究DNA损伤修复基因<italic>FANCI</italic>在肝癌中的表达水平，及其与预后、临床分期、免疫浸润的关系。方法在本研究中，使用TCGA、GTEx、TIMER2.0及qRT-PCR法、蛋白质印迹法和免疫组织化学法研究FANCI在肝癌中的表达及其与不同临床分期之间的相关性；使用Kaplan-Meier Plotter数据库分析FANCI与肝癌预后的关系；使用TISIDB数据库探索FANCI与肝癌免疫细胞浸润及免疫检查点的关系；使用STRING数据库探索FANCI相结合的蛋白；使用TCGA及GTEx数据库进行GO及KEGG富集分析；通过细胞实验探索了FA...
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| Main Authors: | , , , , , , |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | zho |
| Published: |
Editorial Office of Journal of Sun Yat-sen University
2023-01-01
|
| Series: | Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban |
| Subjects: | |
| Online Access: | http://xuebaoyx.sysu.edu.cn/zh/article/doi/10.13471/j.cnki.j.sun.yat-sen.univ(med.sci).2023.0108/ |
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| _version_ | 1841535494994788352 |
|---|---|
| author | 游莹 梅美华 谭宁歆 陈怡丽 池沛冬 何晓顺 黄俊琪 |
| author_facet | 游莹 梅美华 谭宁歆 陈怡丽 池沛冬 何晓顺 黄俊琪 |
| author_sort | 游莹 |
| collection | DOAJ |
| description | 目的探究DNA损伤修复基因<italic>FANCI</italic>在肝癌中的表达水平，及其与预后、临床分期、免疫浸润的关系。方法在本研究中，使用TCGA、GTEx、TIMER2.0及qRT-PCR法、蛋白质印迹法和免疫组织化学法研究FANCI在肝癌中的表达及其与不同临床分期之间的相关性；使用Kaplan-Meier Plotter数据库分析FANCI与肝癌预后的关系；使用TISIDB数据库探索FANCI与肝癌免疫细胞浸润及免疫检查点的关系；使用STRING数据库探索FANCI相结合的蛋白；使用TCGA及GTEx数据库进行GO及KEGG富集分析；通过细胞实验探索了FANCI在肝癌中的作用。结果与正常组织相比，肝癌组织FANCI的mRNA和蛋白表达水平上调（<italic>P</italic><0.001）；高表达FANCI的肝癌患者预后较差（<italic>P</italic><0.001）；肝癌组织中FANCI的表达与组织活化的CD4<sup>+</sup>T细胞数目、Th2细胞数目及免疫检查点基因的表达呈正相关，且FANCI高表达组的B细胞及巨噬细胞浸润水平明显较低（<italic>P</italic><0.01）；GO及KEGG富集分析显示FANCI相关基因富集在氨基酸跨膜转运体活性等多种生物过程中；细胞实验发现敲低FANCI后，肝癌的增殖、侵袭及迁移能力下降（<italic>P</italic><0.05）。结论FANCI在肝癌组织中高表达，可能起抑制抗肿瘤免疫的作用，并作用于氨基酸跨膜转运等通路，与不良预后相关，敲低FANCI后，肝癌的增殖、侵袭及迁移能力得到抑制。 |
| format | Article |
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| institution | Kabale University |
| issn | 1672-3554 |
| language | zho |
| publishDate | 2023-01-01 |
| publisher | Editorial Office of Journal of Sun Yat-sen University |
| record_format | Article |
| series | Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban |
| spelling | doaj-art-e6d933add5ea49959b9abf5bd05a3cbe2025-01-15T02:32:05ZzhoEditorial Office of Journal of Sun Yat-sen UniversityZhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban1672-35542023-01-0144516243474107DNA损伤修复基因<italic>FANCI</italic>与肝癌预后和免疫浸润相关性游莹梅美华谭宁歆陈怡丽池沛冬何晓顺黄俊琪目的探究DNA损伤修复基因<italic>FANCI</italic>在肝癌中的表达水平，及其与预后、临床分期、免疫浸润的关系。方法在本研究中，使用TCGA、GTEx、TIMER2.0及qRT-PCR法、蛋白质印迹法和免疫组织化学法研究FANCI在肝癌中的表达及其与不同临床分期之间的相关性；使用Kaplan-Meier Plotter数据库分析FANCI与肝癌预后的关系；使用TISIDB数据库探索FANCI与肝癌免疫细胞浸润及免疫检查点的关系；使用STRING数据库探索FANCI相结合的蛋白；使用TCGA及GTEx数据库进行GO及KEGG富集分析；通过细胞实验探索了FANCI在肝癌中的作用。结果与正常组织相比，肝癌组织FANCI的mRNA和蛋白表达水平上调（<italic>P</italic><0.001）；高表达FANCI的肝癌患者预后较差（<italic>P</italic><0.001）；肝癌组织中FANCI的表达与组织活化的CD4<sup>+</sup>T细胞数目、Th2细胞数目及免疫检查点基因的表达呈正相关，且FANCI高表达组的B细胞及巨噬细胞浸润水平明显较低（<italic>P</italic><0.01）；GO及KEGG富集分析显示FANCI相关基因富集在氨基酸跨膜转运体活性等多种生物过程中；细胞实验发现敲低FANCI后，肝癌的增殖、侵袭及迁移能力下降（<italic>P</italic><0.05）。结论FANCI在肝癌组织中高表达，可能起抑制抗肿瘤免疫的作用，并作用于氨基酸跨膜转运等通路，与不良预后相关，敲低FANCI后，肝癌的增殖、侵袭及迁移能力得到抑制。http://xuebaoyx.sysu.edu.cn/zh/article/doi/10.13471/j.cnki.j.sun.yat-sen.univ(med.sci).2023.0108/Fanconi贫血补充组Ⅰ肝癌免疫浸润免疫检查点 |
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