DNA损伤修复基因<italic>FANCI</italic>与肝癌预后和免疫浸润相关性

DNA损伤修复基因<italic>FANCI</italic>与肝癌预后和免疫浸润相关性

目的探究DNA损伤修复基因<italic>FANCI</italic>在肝癌中的表达水平，及其与预后、临床分期、免疫浸润的关系。方法在本研究中，使用TCGA、GTEx、TIMER2.0及qRT-PCR法、蛋白质印迹法和免疫组织化学法研究FANCI在肝癌中的表达及其与不同临床分期之间的相关性；使用Kaplan-Meier Plotter数据库分析FANCI与肝癌预后的关系；使用TISIDB数据库探索FANCI与肝癌免疫细胞浸润及免疫检查点的关系；使用STRING数据库探索FANCI相结合的蛋白；使用TCGA及GTEx数据库进行GO及KEGG富集分析；通过细胞实验探索了FA...

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Main Authors: 游莹, 梅美华, 谭宁歆, 陈怡丽, 池沛冬, 何晓顺, 黄俊琪
Format: Article
Language:zho
Published: Editorial Office of Journal of Sun Yat-sen University 2023-01-01
Series:Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban
Subjects:
Fanconi贫血补充组Ⅰ
肝癌
免疫浸润
免疫检查点
Online Access:http://xuebaoyx.sysu.edu.cn/zh/article/doi/10.13471/j.cnki.j.sun.yat-sen.univ(med.sci).2023.0108/
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Summary:目的探究DNA损伤修复基因<italic>FANCI</italic>在肝癌中的表达水平，及其与预后、临床分期、免疫浸润的关系。方法在本研究中，使用TCGA、GTEx、TIMER2.0及qRT-PCR法、蛋白质印迹法和免疫组织化学法研究FANCI在肝癌中的表达及其与不同临床分期之间的相关性；使用Kaplan-Meier Plotter数据库分析FANCI与肝癌预后的关系；使用TISIDB数据库探索FANCI与肝癌免疫细胞浸润及免疫检查点的关系；使用STRING数据库探索FANCI相结合的蛋白；使用TCGA及GTEx数据库进行GO及KEGG富集分析；通过细胞实验探索了FANCI在肝癌中的作用。结果与正常组织相比，肝癌组织FANCI的mRNA和蛋白表达水平上调（<italic>P</italic>&lt;0.001）；高表达FANCI的肝癌患者预后较差（<italic>P</italic>&lt;0.001）；肝癌组织中FANCI的表达与组织活化的CD4<sup>+</sup>T细胞数目、Th2细胞数目及免疫检查点基因的表达呈正相关，且FANCI高表达组的B细胞及巨噬细胞浸润水平明显较低（<italic>P</italic>&lt;0.01）；GO及KEGG富集分析显示FANCI相关基因富集在氨基酸跨膜转运体活性等多种生物过程中；细胞实验发现敲低FANCI后，肝癌的增殖、侵袭及迁移能力下降（<italic>P</italic>&lt;0.05）。结论FANCI在肝癌组织中高表达，可能起抑制抗肿瘤免疫的作用，并作用于氨基酸跨膜转运等通路，与不良预后相关，敲低FANCI后，肝癌的增殖、侵袭及迁移能力得到抑制。
ISSN:1672-3554

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