光学基因组图谱技术在复杂染色体重排中的应用

目的探讨光学基因组图谱技术(OGM)在复杂染色体重排中的应用。方法收集2022年1月到2023年6月期间,在中山大学附属第六医院生殖医学中心进行辅助生殖助孕的染色体复杂重排患者5例,对患者进行OGM检测,纳米孔三代测序和胚胎植入前遗传学检测(PGT),并与核型分析、染色体微阵列分析技术(CMA)/基因组拷贝数变异测序(CNV-Seq)的结果分析对比。结果相互易位合并插入,相互易位合并倒位,三联易位均能被OGM成功检测,且与纳米孔测序和CMA/CNV-Seq结果相符。OGM成功定位断裂点位置,并与胚胎检测结果验证相符。OGM无法检测到罗氏易位。结论OGM因其超长读长,实现了跨越重复区域的检测能力...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Main Authors: 何姝婧, 张志强, 黄乙涓, 徐丽南, 陈元球, 方丛, 任姿
Format: Article
Language:zho
Published: Editorial Office of Journal of Sun Yat-sen University 2023-11-01
Series:Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban
Subjects:
Online Access:http://xuebaoyx.sysu.edu.cn/zh/article/doi/10.13471/j.cnki.j.sun.yat-sen.univ(med.sci).2023.0625/
Tags: Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
_version_ 1841528234757324800
author 何姝婧
张志强
黄乙涓
徐丽南
陈元球
方丛
任姿
author_facet 何姝婧
张志强
黄乙涓
徐丽南
陈元球
方丛
任姿
author_sort 何姝婧
collection DOAJ
description 目的探讨光学基因组图谱技术(OGM)在复杂染色体重排中的应用。方法收集2022年1月到2023年6月期间,在中山大学附属第六医院生殖医学中心进行辅助生殖助孕的染色体复杂重排患者5例,对患者进行OGM检测,纳米孔三代测序和胚胎植入前遗传学检测(PGT),并与核型分析、染色体微阵列分析技术(CMA)/基因组拷贝数变异测序(CNV-Seq)的结果分析对比。结果相互易位合并插入,相互易位合并倒位,三联易位均能被OGM成功检测,且与纳米孔测序和CMA/CNV-Seq结果相符。OGM成功定位断裂点位置,并与胚胎检测结果验证相符。OGM无法检测到罗氏易位。结论OGM因其超长读长,实现了跨越重复区域的检测能力,能够准确定位结构重排,可以有效地辅助复杂染色体重排的临床诊断。
format Article
id doaj-art-dbf8e8b69ca04eb89b9e06472c313399
institution Kabale University
issn 1672-3554
language zho
publishDate 2023-11-01
publisher Editorial Office of Journal of Sun Yat-sen University
record_format Article
series Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban
spelling doaj-art-dbf8e8b69ca04eb89b9e06472c3133992025-01-15T03:54:07ZzhoEditorial Office of Journal of Sun Yat-sen UniversityZhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban1672-35542023-11-014494394844662517光学基因组图谱技术在复杂染色体重排中的应用何姝婧张志强黄乙涓徐丽南陈元球方丛任姿目的探讨光学基因组图谱技术(OGM)在复杂染色体重排中的应用。方法收集2022年1月到2023年6月期间,在中山大学附属第六医院生殖医学中心进行辅助生殖助孕的染色体复杂重排患者5例,对患者进行OGM检测,纳米孔三代测序和胚胎植入前遗传学检测(PGT),并与核型分析、染色体微阵列分析技术(CMA)/基因组拷贝数变异测序(CNV-Seq)的结果分析对比。结果相互易位合并插入,相互易位合并倒位,三联易位均能被OGM成功检测,且与纳米孔测序和CMA/CNV-Seq结果相符。OGM成功定位断裂点位置,并与胚胎检测结果验证相符。OGM无法检测到罗氏易位。结论OGM因其超长读长,实现了跨越重复区域的检测能力,能够准确定位结构重排,可以有效地辅助复杂染色体重排的临床诊断。http://xuebaoyx.sysu.edu.cn/zh/article/doi/10.13471/j.cnki.j.sun.yat-sen.univ(med.sci).2023.0625/光学基因组图谱技术纳米孔测序复杂染色体重排胚胎植入前遗传学检测辅助生殖
spellingShingle 何姝婧
张志强
黄乙涓
徐丽南
陈元球
方丛
任姿
光学基因组图谱技术在复杂染色体重排中的应用
Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban
光学基因组图谱技术
纳米孔测序
复杂染色体重排
胚胎植入前遗传学检测
辅助生殖
title 光学基因组图谱技术在复杂染色体重排中的应用
title_full 光学基因组图谱技术在复杂染色体重排中的应用
title_fullStr 光学基因组图谱技术在复杂染色体重排中的应用
title_full_unstemmed 光学基因组图谱技术在复杂染色体重排中的应用
title_short 光学基因组图谱技术在复杂染色体重排中的应用
title_sort 光学基因组图谱技术在复杂染色体重排中的应用
topic 光学基因组图谱技术
纳米孔测序
复杂染色体重排
胚胎植入前遗传学检测
辅助生殖
url http://xuebaoyx.sysu.edu.cn/zh/article/doi/10.13471/j.cnki.j.sun.yat-sen.univ(med.sci).2023.0625/
work_keys_str_mv AT héshūjìng guāngxuéjīyīnzǔtúpǔjìshùzàifùzárǎnsètǐzhòngpáizhōngdeyīngyòng
AT zhāngzhìqiáng guāngxuéjīyīnzǔtúpǔjìshùzàifùzárǎnsètǐzhòngpáizhōngdeyīngyòng
AT huángyǐjuān guāngxuéjīyīnzǔtúpǔjìshùzàifùzárǎnsètǐzhòngpáizhōngdeyīngyòng
AT xúlìnán guāngxuéjīyīnzǔtúpǔjìshùzàifùzárǎnsètǐzhòngpáizhōngdeyīngyòng
AT chényuánqiú guāngxuéjīyīnzǔtúpǔjìshùzàifùzárǎnsètǐzhòngpáizhōngdeyīngyòng
AT fāngcóng guāngxuéjīyīnzǔtúpǔjìshùzàifùzárǎnsètǐzhòngpáizhōngdeyīngyòng
AT rènzī guāngxuéjīyīnzǔtúpǔjìshùzàifùzárǎnsètǐzhòngpáizhōngdeyīngyòng