استفاده از روش توالی‌یابی اگزوم در شناسایی جهش‌های ژنتیکی کاردیومیوپاتی هایپرتروفیک و کاردیومیوپاتی اتساعی

مقاله پژوهشیمقدمه: کاردیومیوپاتی هایپرتروفیک و کاردیومیوپاتی اتساعی، عمدتاً با تظاهرات بالینی مختلف و در افراد با سابقه‌ی ژنتیکی پدیدار می‌شوند، در این حالت توالی‌یابی اگزوم امکان بررسی جامع از مناطق کدکننده‌ی پروتئین ژنوم را فراهم می‌کند و شناسایی انواع واریانت‌های نادر و بالقوه‌ی بیماری‌‌زا مرتبط...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Main Authors: دینازهرا مختاری, فاطمه اکبریان, پریسا علی دوست سلیمی, سمیرا کلائی نیا
Format: Article
Language:fas
Published: Isfahan University of Medical Sciences 2024-08-01
Series:مجله دانشکده پزشکی اصفهان
Subjects:
Online Access:https://jims.mui.ac.ir/article_31281_80a113fa4b4a32d24ca8a1a9fb5491a1.pdf
Tags: Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
_version_ 1841545379345072128
author دینازهرا مختاری
فاطمه اکبریان
پریسا علی دوست سلیمی
سمیرا کلائی نیا
author_facet دینازهرا مختاری
فاطمه اکبریان
پریسا علی دوست سلیمی
سمیرا کلائی نیا
author_sort دینازهرا مختاری
collection DOAJ
description مقاله پژوهشیمقدمه: کاردیومیوپاتی هایپرتروفیک و کاردیومیوپاتی اتساعی، عمدتاً با تظاهرات بالینی مختلف و در افراد با سابقه‌ی ژنتیکی پدیدار می‌شوند، در این حالت توالی‌یابی اگزوم امکان بررسی جامع از مناطق کدکننده‌ی پروتئین ژنوم را فراهم می‌کند و شناسایی انواع واریانت‌های نادر و بالقوه‌ی بیماری‌‌زا مرتبط با این شرایط را تسهیل می‌نماید. علاوه براین، داده‌‌های حاصل از توالی‌یابی اگزوم می‌تواند بینش گسترده‌تری را در مورد مکانیسم‌های مولکولی مؤثر در پاتوژنز کاردیومیوپاتی هایپرتروفیک و اتساعی ارایه دهد.روش‌ها: نمونه‌ی خون از دو فرد بیمار از دو خانواده ایرانی دارای کاردیومیوپاتی هایپرتروفیک و کاردیومیوپاتی اتساعی و اعضای خانواده‌های آن‌ها جمع‌آوری گردید، سپس با استفاده از روش Salting out، نمونه‌ی DNA آن‌ها استخراج شد. نمونه‌ها جهت انجام توالی‌یابی اگزوم به شرکت ماکروژن کره جنوبی ارسال شدند و سپس داده خام در مرکز قلب و عروق شهید رجائی مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. طراحی پرایمر و PCR برای واریانت‌های کاندید و همچنین توالی‌یابی سنگر برای بیماران و خانواده آن‌ها انجام شد.یافته‌ها: در این مطالعه، دو واریانت گزارش شده‌ی مختلف، یکی در ژن  TPM1 (A:p.E156K< c.466G) و دیگری در ژنACTN2  (c.2648C>T:p.A883V)     در خانواده‌ی A (هردو هتروزیگوت) و یک واریانت گزارش شده در ژن (c.2218C>T:p.R740X)  در خانواده‌ی B (هموزیگوت) شناسایی شدند. جهش‌های یافته شده در بیماران تأیید و در اعضای خانواده‌ی سگرگیت شد.نتیجه‌گیری: نتایج مطالعه‌ی حاضر نشان داد، جهش‌های ژن‌هایTPM1،ACTN2  و NRAP در خانواده‌های دارای افراد مبتلا به کاردیومیوپاتی می‌تواند در علت‌یابی بیماری و شناسایی افراد در معرض خطر خانواده، کمک‌کننده می‌باشد.
format Article
id doaj-art-bb975e3e131741cbafe504fb24fc7848
institution Kabale University
issn 1027-7595
1735-854X
language fas
publishDate 2024-08-01
publisher Isfahan University of Medical Sciences
record_format Article
series مجله دانشکده پزشکی اصفهان
spelling doaj-art-bb975e3e131741cbafe504fb24fc78482025-01-12T07:12:40ZfasIsfahan University of Medical Sciencesمجله دانشکده پزشکی اصفهان1027-75951735-854X2024-08-014277457458110.48305/jims.v42.i774.057431281استفاده از روش توالی‌یابی اگزوم در شناسایی جهش‌های ژنتیکی کاردیومیوپاتی هایپرتروفیک و کاردیومیوپاتی اتساعیدینازهرا مختاری0فاطمه اکبریان1پریسا علی دوست سلیمی2سمیرا کلائی نیا3کارشناسی ارشد، گروه ژنتیک، دانشکده‌ی علوم پایه، مؤسسه آموزش عالی آل طه، تهران، ایراناستادیار، گروه ژنتیک، دانشکده‌ی علوم پایه، مؤسسه آموزش عالی آل طه، تهران، ایراندکتری تخصصی، مرکز قلب و عروق شهیدرجایی، دانشگاه علوم پزشکی ایران، تهران، ایراناستادیار، مرکز تحقیقات کاردیوژنتیک، مرکز قلب و عروق شهیدرجایی، دانشگاه علوم پزشکی ایران، تهران، ایرانمقاله پژوهشیمقدمه: کاردیومیوپاتی هایپرتروفیک و کاردیومیوپاتی اتساعی، عمدتاً با تظاهرات بالینی مختلف و در افراد با سابقه‌ی ژنتیکی پدیدار می‌شوند، در این حالت توالی‌یابی اگزوم امکان بررسی جامع از مناطق کدکننده‌ی پروتئین ژنوم را فراهم می‌کند و شناسایی انواع واریانت‌های نادر و بالقوه‌ی بیماری‌‌زا مرتبط با این شرایط را تسهیل می‌نماید. علاوه براین، داده‌‌های حاصل از توالی‌یابی اگزوم می‌تواند بینش گسترده‌تری را در مورد مکانیسم‌های مولکولی مؤثر در پاتوژنز کاردیومیوپاتی هایپرتروفیک و اتساعی ارایه دهد.روش‌ها: نمونه‌ی خون از دو فرد بیمار از دو خانواده ایرانی دارای کاردیومیوپاتی هایپرتروفیک و کاردیومیوپاتی اتساعی و اعضای خانواده‌های آن‌ها جمع‌آوری گردید، سپس با استفاده از روش Salting out، نمونه‌ی DNA آن‌ها استخراج شد. نمونه‌ها جهت انجام توالی‌یابی اگزوم به شرکت ماکروژن کره جنوبی ارسال شدند و سپس داده خام در مرکز قلب و عروق شهید رجائی مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. طراحی پرایمر و PCR برای واریانت‌های کاندید و همچنین توالی‌یابی سنگر برای بیماران و خانواده آن‌ها انجام شد.یافته‌ها: در این مطالعه، دو واریانت گزارش شده‌ی مختلف، یکی در ژن  TPM1 (A:p.E156K< c.466G) و دیگری در ژنACTN2  (c.2648C>T:p.A883V)     در خانواده‌ی A (هردو هتروزیگوت) و یک واریانت گزارش شده در ژن (c.2218C>T:p.R740X)  در خانواده‌ی B (هموزیگوت) شناسایی شدند. جهش‌های یافته شده در بیماران تأیید و در اعضای خانواده‌ی سگرگیت شد.نتیجه‌گیری: نتایج مطالعه‌ی حاضر نشان داد، جهش‌های ژن‌هایTPM1،ACTN2  و NRAP در خانواده‌های دارای افراد مبتلا به کاردیومیوپاتی می‌تواند در علت‌یابی بیماری و شناسایی افراد در معرض خطر خانواده، کمک‌کننده می‌باشد.https://jims.mui.ac.ir/article_31281_80a113fa4b4a32d24ca8a1a9fb5491a1.pdfکاردیومیوپاتیتوالی‌یابی اگزومجهشبیماری‌های قلبیایران
spellingShingle دینازهرا مختاری
فاطمه اکبریان
پریسا علی دوست سلیمی
سمیرا کلائی نیا
استفاده از روش توالی‌یابی اگزوم در شناسایی جهش‌های ژنتیکی کاردیومیوپاتی هایپرتروفیک و کاردیومیوپاتی اتساعی
مجله دانشکده پزشکی اصفهان
کاردیومیوپاتی
توالی‌یابی اگزوم
جهش
بیماری‌های قلبی
ایران
title استفاده از روش توالی‌یابی اگزوم در شناسایی جهش‌های ژنتیکی کاردیومیوپاتی هایپرتروفیک و کاردیومیوپاتی اتساعی
title_full استفاده از روش توالی‌یابی اگزوم در شناسایی جهش‌های ژنتیکی کاردیومیوپاتی هایپرتروفیک و کاردیومیوپاتی اتساعی
title_fullStr استفاده از روش توالی‌یابی اگزوم در شناسایی جهش‌های ژنتیکی کاردیومیوپاتی هایپرتروفیک و کاردیومیوپاتی اتساعی
title_full_unstemmed استفاده از روش توالی‌یابی اگزوم در شناسایی جهش‌های ژنتیکی کاردیومیوپاتی هایپرتروفیک و کاردیومیوپاتی اتساعی
title_short استفاده از روش توالی‌یابی اگزوم در شناسایی جهش‌های ژنتیکی کاردیومیوپاتی هایپرتروفیک و کاردیومیوپاتی اتساعی
title_sort استفاده از روش توالی‌یابی اگزوم در شناسایی جهش‌های ژنتیکی کاردیومیوپاتی هایپرتروفیک و کاردیومیوپاتی اتساعی
topic کاردیومیوپاتی
توالی‌یابی اگزوم
جهش
بیماری‌های قلبی
ایران
url https://jims.mui.ac.ir/article_31281_80a113fa4b4a32d24ca8a1a9fb5491a1.pdf
work_keys_str_mv AT dynạzhrạmkẖtạry ạstfạdhạzrwsẖtwạlyyạbyạgzwmdrsẖnạsạyyjhsẖhạyzẖntyḵyḵạrdywmywpạtyhạyprtrwfyḵwḵạrdywmywpạtyạtsạʿy
AT fạṭmhạḵbryạn ạstfạdhạzrwsẖtwạlyyạbyạgzwmdrsẖnạsạyyjhsẖhạyzẖntyḵyḵạrdywmywpạtyhạyprtrwfyḵwḵạrdywmywpạtyạtsạʿy
AT prysạʿlydwstslymy ạstfạdhạzrwsẖtwạlyyạbyạgzwmdrsẖnạsạyyjhsẖhạyzẖntyḵyḵạrdywmywpạtyhạyprtrwfyḵwḵạrdywmywpạtyạtsạʿy
AT smyrạḵlạỷynyạ ạstfạdhạzrwsẖtwạlyyạbyạgzwmdrsẖnạsạyyjhsẖhạyzẖntyḵyḵạrdywmywpạtyhạyprtrwfyḵwḵạrdywmywpạtyạtsạʿy