豚鹿SSR标记开发与遗传多样性分析
以上海动物园圈养豚鹿(<i>Axis porcinus</i>)日常体检中抽取的血液为试验样品提取总DNA,利用高通量测序技术对通过探针富集得到的SSR序列测序,并用MISA检索SSR标记。结果表明:单碱基重复SSR到六碱基重复SSR在豚鹿基因组中均有分布,其中双碱基重复占比最高,在双碱基重复中以AC/GT重复为主。本研究成功开发出7个SSR标记,这些标记在22只豚鹿个体中检测到等位基因2～5个,在豚鹿种群中的平均多态信息含量(PIC)为0.421,平均期望杂合度(<i>H</i><sub>e</sub>)为0.513。7...
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| Main Authors: | , , |
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| Format: | Article |
| Language: | zho |
| Published: |
Editorial Department of Chinese Journal of Wildlife
2022-01-01
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| Series: | 野生动物学报 |
| Subjects: | |
| Online Access: | http://ysdw.nefu.edu.cn/thesisDetails#10.12375/ysdwxb.20220329 |
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| author | 耿广耀 由玉岩 刘群秀 |
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| description | 以上海动物园圈养豚鹿(<i>Axis porcinus</i>)日常体检中抽取的血液为试验样品提取总DNA,利用高通量测序技术对通过探针富集得到的SSR序列测序,并用MISA检索SSR标记。结果表明:单碱基重复SSR到六碱基重复SSR在豚鹿基因组中均有分布,其中双碱基重复占比最高,在双碱基重复中以AC/GT重复为主。本研究成功开发出7个SSR标记,这些标记在22只豚鹿个体中检测到等位基因2～5个,在豚鹿种群中的平均多态信息含量(PIC)为0.421,平均期望杂合度(<i>H</i><sub>e</sub>)为0.513。7个SSR标记中有3个高度多态标记、3个中度多态标记和1个低度多态标记,可用于豚鹿的遗传多样性研究。 |
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| institution | Kabale University |
| issn | 2310-1490 |
| language | zho |
| publishDate | 2022-01-01 |
| publisher | Editorial Department of Chinese Journal of Wildlife |
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| series | 野生动物学报 |
| spelling | doaj-art-baeba69275ee4e86b419bfd35993b9cc2025-01-14T04:07:47ZzhoEditorial Department of Chinese Journal of Wildlife野生动物学报2310-14902022-01-0181682067052993豚鹿SSR标记开发与遗传多样性分析耿广耀由玉岩刘群秀以上海动物园圈养豚鹿(<i>Axis porcinus</i>)日常体检中抽取的血液为试验样品提取总DNA,利用高通量测序技术对通过探针富集得到的SSR序列测序,并用MISA检索SSR标记。结果表明:单碱基重复SSR到六碱基重复SSR在豚鹿基因组中均有分布,其中双碱基重复占比最高,在双碱基重复中以AC/GT重复为主。本研究成功开发出7个SSR标记,这些标记在22只豚鹿个体中检测到等位基因2～5个,在豚鹿种群中的平均多态信息含量(PIC)为0.421,平均期望杂合度(<i>H</i><sub>e</sub>)为0.513。7个SSR标记中有3个高度多态标记、3个中度多态标记和1个低度多态标记,可用于豚鹿的遗传多样性研究。http://ysdw.nefu.edu.cn/thesisDetails#10.12375/ysdwxb.20220329豚鹿微卫星分子标记开发遗传多样性 |
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