基于COI和Cytb基因的黄腰响蜜系统发育分析和分歧时间估算
随着分子生物技术的迅速发展,物种分化的过程及原因成为进化生物学和生态学研究的热点之一。黄腰响蜜(Indicator xanthonotus)是中国分布的唯一的响蜜科鸟类,其系统发生关系和分化时间尚不清楚。本文运用细胞色素c氧化酶I亚基(COI)和细胞色素b(Cytb)基因作为分子标记,结合NCBI获取到的19个物种的COI和Cytb基因序列,采用最大似然法及贝叶斯法构建系统发育树,探讨了黄腰响蜜的系统发育及起源的问题,通过分子定时的方法估算黄腰响蜜的分化时间。结果表明:黄腰响蜜与响蜜科其余3个物种聚为一支,是此科中最先分化出来的物种,位于响蜜科分支的基部;黄腰响蜜与鳞喉响蜜(...
Saved in:
Main Authors: | , , |
---|---|
Format: | Article |
Language: | zho |
Published: |
Editorial Department of Chinese Journal of Wildlife
2021-01-01
|
Series: | 野生动物学报 |
Subjects: | |
Online Access: | http://ysdw.nefu.edu.cn/thesisDetails?columnId=67050835&Fpath=home&index=0 |
Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
_version_ | 1841542384593141760 |
---|---|
author | 元青苗 1 2 段玉宝 1 2 |
author_facet | 元青苗 1 2 段玉宝 1 2 |
author_sort | 元青苗 1 |
collection | DOAJ |
description | 随着分子生物技术的迅速发展,物种分化的过程及原因成为进化生物学和生态学研究的热点之一。黄腰响蜜(Indicator xanthonotus)是中国分布的唯一的响蜜科鸟类,其系统发生关系和分化时间尚不清楚。本文运用细胞色素c氧化酶I亚基(COI)和细胞色素b(Cytb)基因作为分子标记,结合NCBI获取到的19个物种的COI和Cytb基因序列,采用最大似然法及贝叶斯法构建系统发育树,探讨了黄腰响蜜的系统发育及起源的问题,通过分子定时的方法估算黄腰响蜜的分化时间。结果表明:黄腰响蜜与响蜜科其余3个物种聚为一支,是此科中最先分化出来的物种,位于响蜜科分支的基部;黄腰响蜜与鳞喉响蜜(Ivariegatus)类群的遗传距离最小,与小响蜜(Iexilis)类群的遗传距离最大;黄腰响蜜的分化时间可以追溯到中新世阶段(时间节点为2044 Ma)。 |
format | Article |
id | doaj-art-b505e4327e6e4c888374822a14b85bdf |
institution | Kabale University |
issn | 2310-1490 |
language | zho |
publishDate | 2021-01-01 |
publisher | Editorial Department of Chinese Journal of Wildlife |
record_format | Article |
series | 野生动物学报 |
spelling | doaj-art-b505e4327e6e4c888374822a14b85bdf2025-01-14T04:13:15ZzhoEditorial Department of Chinese Journal of Wildlife野生动物学报2310-14902021-01-0114315067050835基于COI和Cytb基因的黄腰响蜜系统发育分析和分歧时间估算元青苗 12 段玉宝 12随着分子生物技术的迅速发展,物种分化的过程及原因成为进化生物学和生态学研究的热点之一。黄腰响蜜(Indicator xanthonotus)是中国分布的唯一的响蜜科鸟类,其系统发生关系和分化时间尚不清楚。本文运用细胞色素c氧化酶I亚基(COI)和细胞色素b(Cytb)基因作为分子标记,结合NCBI获取到的19个物种的COI和Cytb基因序列,采用最大似然法及贝叶斯法构建系统发育树,探讨了黄腰响蜜的系统发育及起源的问题,通过分子定时的方法估算黄腰响蜜的分化时间。结果表明:黄腰响蜜与响蜜科其余3个物种聚为一支,是此科中最先分化出来的物种,位于响蜜科分支的基部;黄腰响蜜与鳞喉响蜜(Ivariegatus)类群的遗传距离最小,与小响蜜(Iexilis)类群的遗传距离最大;黄腰响蜜的分化时间可以追溯到中新世阶段(时间节点为2044 Ma)。http://ysdw.nefu.edu.cn/thesisDetails?columnId=67050835&Fpath=home&index=0黄腰响蜜COI基因Cytb基因系统发育分歧时间 |
spellingShingle | 元青苗 1 2 段玉宝 1 2 基于COI和Cytb基因的黄腰响蜜系统发育分析和分歧时间估算 野生动物学报 黄腰响蜜 COI基因 Cytb基因 系统发育 分歧时间 |
title | 基于COI和Cytb基因的黄腰响蜜系统发育分析和分歧时间估算 |
title_full | 基于COI和Cytb基因的黄腰响蜜系统发育分析和分歧时间估算 |
title_fullStr | 基于COI和Cytb基因的黄腰响蜜系统发育分析和分歧时间估算 |
title_full_unstemmed | 基于COI和Cytb基因的黄腰响蜜系统发育分析和分歧时间估算 |
title_short | 基于COI和Cytb基因的黄腰响蜜系统发育分析和分歧时间估算 |
title_sort | 基于coi和cytb基因的黄腰响蜜系统发育分析和分歧时间估算 |
topic | 黄腰响蜜 COI基因 Cytb基因 系统发育 分歧时间 |
url | http://ysdw.nefu.edu.cn/thesisDetails?columnId=67050835&Fpath=home&index=0 |
work_keys_str_mv | AT yuánqīngmiáo1 jīyúcoihécytbjīyīndehuángyāoxiǎngmìxìtǒngfāyùfēnxīhéfēnqíshíjiāngūsuàn AT 2duànyùbǎo1 jīyúcoihécytbjīyīndehuángyāoxiǎngmìxìtǒngfāyùfēnxīhéfēnqíshíjiāngūsuàn AT 2 jīyúcoihécytbjīyīndehuángyāoxiǎngmìxìtǒngfāyùfēnxīhéfēnqíshíjiāngūsuàn |