塔里木兔线粒体基因组全序列分析与系统进化研究

塔里木兔线粒体基因组全序列分析与系统进化研究

塔里木兔是我国新疆地区特有物种，已被列为国家Ⅱ级重点保护动物。本研究基于所测定的塔里木兔线粒体全基因组序列（全长17011 bp），进行了全序列的结构分析，结果表明塔里木兔线粒体基因组包含13个蛋白质编码基因、22个tRNA基因、2个rRNA基因和1个控制区。除了nad6在L链上以外，其他的蛋白质编码基因都在H链上。基于线粒体基因序列，通过生物信息学预测发现除了trnM和trnS1以外，其余tRNA都有经典的三叶草二级结构。线粒体全基因组具有AT偏好性，其结构与目前兔属其他物种线粒体基因组结构类似。并基于塔里木兔和GeneBank已有的12种兔属物种线粒体全基因组序列，分别用ML法和NJ法构建...

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Bibliographic Details
Main Authors: 黄娅琳 1, 2 黄捷 3 时玉 1 徐燕红 2 周用武 1 侯森林 2
Format: Article
Language:zho
Published: Editorial Department of Chinese Journal of Wildlife 2021-01-01
Series:野生动物学报
Subjects:
塔里木兔
线粒体基因组
特征分析
遗传多样性
Online Access:http://ysdw.nefu.edu.cn/thesisDetails?columnId=67054485&Fpath=home&index=0
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Description
Summary:塔里木兔是我国新疆地区特有物种，已被列为国家Ⅱ级重点保护动物。本研究基于所测定的塔里木兔线粒体全基因组序列（全长17011 bp），进行了全序列的结构分析，结果表明塔里木兔线粒体基因组包含13个蛋白质编码基因、22个tRNA基因、2个rRNA基因和1个控制区。除了nad6在L链上以外，其他的蛋白质编码基因都在H链上。基于线粒体基因序列，通过生物信息学预测发现除了trnM和trnS1以外，其余tRNA都有经典的三叶草二级结构。线粒体全基因组具有AT偏好性，其结构与目前兔属其他物种线粒体基因组结构类似。并基于塔里木兔和GeneBank已有的12种兔属物种线粒体全基因组序列，分别用ML法和NJ法构建系统进化树，对其系统发生进行了探讨，结果表明塔里木兔与蒙古兔的亲缘关系较近。
ISSN:2310-1490

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