梅花鹿源彭氏变形杆菌F2d株基因组的测序分析

为探究鹿源彭氏变形杆菌(<italic>Proteus penneri</italic>)致病及耐药机制,利用二代测序技术对从云南野生动物园病死梅花鹿(<italic>Cervus nippon</italic>)肺组织中分离鉴定出的1株彭氏变形杆菌F2d株进行基因组测序,将获得的F2d株基因组序列注释到毒力因子、耐药基因和代谢通路等数据库中。毒力因子数据库注释结果显示,菌株含黏附、营养代谢、运动和免疫调节等类型毒力因子;耐药基因数据库注释结果显示,F2d株对<italic>β</italic>-内酰胺类、四环素类、黏菌素...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Main Authors: 孙嘉良, 赵浪, 李佳丹扬, 刘垒成, 吴培福
Format: Article
Language:zho
Published: Editorial Department of Chinese Journal of Wildlife 2024-08-01
Series:野生动物学报
Subjects:
Online Access:http://ysdw.nefu.edu.cn/thesisDetails#10.12375/ysdwxb.20240307
Tags: Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
_version_ 1841541904829775872
author 孙嘉良
赵浪
李佳丹扬
刘垒成
吴培福
author_facet 孙嘉良
赵浪
李佳丹扬
刘垒成
吴培福
author_sort 孙嘉良
collection DOAJ
description 为探究鹿源彭氏变形杆菌(<italic>Proteus penneri</italic>)致病及耐药机制,利用二代测序技术对从云南野生动物园病死梅花鹿(<italic>Cervus nippon</italic>)肺组织中分离鉴定出的1株彭氏变形杆菌F2d株进行基因组测序,将获得的F2d株基因组序列注释到毒力因子、耐药基因和代谢通路等数据库中。毒力因子数据库注释结果显示,菌株含黏附、营养代谢、运动和免疫调节等类型毒力因子;耐药基因数据库注释结果显示,F2d株对<italic>β</italic>-内酰胺类、四环素类、黏菌素类和磺胺类等多种抗生素耐药,并且携带多种抗生素外排机制编码基因;代谢通路数据库注释结果显示,注释的基因富集在42个通路上,其中新陈代谢相关注释的基因数量最多,共有2 250个基因分布在12个通路上。利用基因组测序技术分析鹿源彭氏杆菌F2d株致病性、耐药情况及代谢特点,可为预防彭氏变形杆菌感染和相关药物的研发提供理论依据。
format Article
id doaj-art-805844251f7547449d55bff61658ccbe
institution Kabale University
issn 2310-1490
language zho
publishDate 2024-08-01
publisher Editorial Department of Chinese Journal of Wildlife
record_format Article
series 野生动物学报
spelling doaj-art-805844251f7547449d55bff61658ccbe2025-01-14T04:22:30ZzhoEditorial Department of Chinese Journal of Wildlife野生动物学报2310-14902024-08-014551352067406270梅花鹿源彭氏变形杆菌F2d株基因组的测序分析孙嘉良赵浪李佳丹扬刘垒成吴培福为探究鹿源彭氏变形杆菌(<italic>Proteus penneri</italic>)致病及耐药机制,利用二代测序技术对从云南野生动物园病死梅花鹿(<italic>Cervus nippon</italic>)肺组织中分离鉴定出的1株彭氏变形杆菌F2d株进行基因组测序,将获得的F2d株基因组序列注释到毒力因子、耐药基因和代谢通路等数据库中。毒力因子数据库注释结果显示,菌株含黏附、营养代谢、运动和免疫调节等类型毒力因子;耐药基因数据库注释结果显示,F2d株对<italic>β</italic>-内酰胺类、四环素类、黏菌素类和磺胺类等多种抗生素耐药,并且携带多种抗生素外排机制编码基因;代谢通路数据库注释结果显示,注释的基因富集在42个通路上,其中新陈代谢相关注释的基因数量最多,共有2 250个基因分布在12个通路上。利用基因组测序技术分析鹿源彭氏杆菌F2d株致病性、耐药情况及代谢特点,可为预防彭氏变形杆菌感染和相关药物的研发提供理论依据。http://ysdw.nefu.edu.cn/thesisDetails#10.12375/ysdwxb.20240307基因组测序梅花鹿彭氏变形杆菌毒力与耐药基因功能分析
spellingShingle 孙嘉良
赵浪
李佳丹扬
刘垒成
吴培福
梅花鹿源彭氏变形杆菌F2d株基因组的测序分析
野生动物学报
基因组测序
梅花鹿
彭氏变形杆菌
毒力与耐药基因
功能分析
title 梅花鹿源彭氏变形杆菌F2d株基因组的测序分析
title_full 梅花鹿源彭氏变形杆菌F2d株基因组的测序分析
title_fullStr 梅花鹿源彭氏变形杆菌F2d株基因组的测序分析
title_full_unstemmed 梅花鹿源彭氏变形杆菌F2d株基因组的测序分析
title_short 梅花鹿源彭氏变形杆菌F2d株基因组的测序分析
title_sort 梅花鹿源彭氏变形杆菌f2d株基因组的测序分析
topic 基因组测序
梅花鹿
彭氏变形杆菌
毒力与耐药基因
功能分析
url http://ysdw.nefu.edu.cn/thesisDetails#10.12375/ysdwxb.20240307
work_keys_str_mv AT sūnjiāliáng méihuālùyuánpéngshìbiànxínggānjūnf2dzhūjīyīnzǔdecèxùfēnxī
AT zhàolàng méihuālùyuánpéngshìbiànxínggānjūnf2dzhūjīyīnzǔdecèxùfēnxī
AT lǐjiādānyáng méihuālùyuánpéngshìbiànxínggānjūnf2dzhūjīyīnzǔdecèxùfēnxī
AT liúlěichéng méihuālùyuánpéngshìbiànxínggānjūnf2dzhūjīyīnzǔdecèxùfēnxī
AT wúpéifú méihuālùyuánpéngshìbiànxínggānjūnf2dzhūjīyīnzǔdecèxùfēnxī