梅花鹿源彭氏变形杆菌F2d株基因组的测序分析
为探究鹿源彭氏变形杆菌(<italic>Proteus penneri</italic>)致病及耐药机制,利用二代测序技术对从云南野生动物园病死梅花鹿(<italic>Cervus nippon</italic>)肺组织中分离鉴定出的1株彭氏变形杆菌F2d株进行基因组测序,将获得的F2d株基因组序列注释到毒力因子、耐药基因和代谢通路等数据库中。毒力因子数据库注释结果显示,菌株含黏附、营养代谢、运动和免疫调节等类型毒力因子;耐药基因数据库注释结果显示,F2d株对<italic>β</italic>-内酰胺类、四环素类、黏菌素...
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Published: |
Editorial Department of Chinese Journal of Wildlife
2024-08-01
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author | 孙嘉良 赵浪 李佳丹扬 刘垒成 吴培福 |
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description | 为探究鹿源彭氏变形杆菌(<italic>Proteus penneri</italic>)致病及耐药机制,利用二代测序技术对从云南野生动物园病死梅花鹿(<italic>Cervus nippon</italic>)肺组织中分离鉴定出的1株彭氏变形杆菌F2d株进行基因组测序,将获得的F2d株基因组序列注释到毒力因子、耐药基因和代谢通路等数据库中。毒力因子数据库注释结果显示,菌株含黏附、营养代谢、运动和免疫调节等类型毒力因子;耐药基因数据库注释结果显示,F2d株对<italic>β</italic>-内酰胺类、四环素类、黏菌素类和磺胺类等多种抗生素耐药,并且携带多种抗生素外排机制编码基因;代谢通路数据库注释结果显示,注释的基因富集在42个通路上,其中新陈代谢相关注释的基因数量最多,共有2 250个基因分布在12个通路上。利用基因组测序技术分析鹿源彭氏杆菌F2d株致病性、耐药情况及代谢特点,可为预防彭氏变形杆菌感染和相关药物的研发提供理论依据。 |
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publisher | Editorial Department of Chinese Journal of Wildlife |
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