E2F转录因子2对多发性骨髓瘤细胞粘附的影响

E2F转录因子2对多发性骨髓瘤细胞粘附的影响

目的结合生物信息学途径和细胞分子实验，探讨E2F转录因子2（<italic>E2F2</italic>）对多发性骨髓瘤细胞粘附的影响。方法首先，利用临床样本和GEO数据库分析<italic>E2F2</italic>在骨髓瘤中的表达水平与患者的预后关系。其次，从敲低<italic>E2F2</italic>的骨髓瘤细胞系MM.1S的RNA-seq数据中筛选差异基因，并进行GO功能富集和KEGG信号通路分析，同时，利用string网站进行蛋白互作网络分析。构建稳定敲低<italic>E2F2</italic...

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Main Authors: 麦芷莹, 陈淑娜, 张幸鼎, 赵文婧, 郑永江
Format: Article
Language:zho
Published: Editorial Office of Journal of Sun Yat-sen University 2022-05-01
Series:Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban
Subjects:
多发性骨髓瘤
E2F2
细胞粘附
Online Access:http://xuebaoyx.sysu.edu.cn/zh/article/doi/10.13471/j.cnki.j.sun.yat-sen.univ(med.sci).2022.0304/
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Description
Summary:目的结合生物信息学途径和细胞分子实验，探讨E2F转录因子2（<italic>E2F2</italic>）对多发性骨髓瘤细胞粘附的影响。方法首先，利用临床样本和GEO数据库分析<italic>E2F2</italic>在骨髓瘤中的表达水平与患者的预后关系。其次，从敲低<italic>E2F2</italic>的骨髓瘤细胞系MM.1S的RNA-seq数据中筛选差异基因，并进行GO功能富集和KEGG信号通路分析，同时，利用string网站进行蛋白互作网络分析。构建稳定敲低<italic>E2F2</italic>的骨髓瘤细胞系MM.1S，并经蛋白印迹法（Western Blot）和荧光定量PCR（qRT-PCR）检测<italic>E2F2</italic>的表达水平。通过细胞粘附实验检测稳定敲低<italic>E2F2</italic>对骨髓瘤细胞粘附的影响，利用qRT-PCR检测稳定敲低<italic>E2F2</italic>后细胞粘附相关基因的表达变化。通过细胞迁移实验检测稳定敲低<italic>E2F2</italic>对骨髓瘤细胞迁移的影响。结果我们在骨髓瘤患者的临床样本中观察到<italic>E2F2</italic>的表达显著升高，GEO数据库结果显示<italic>E2F2</italic>在骨髓瘤中高表达提示患者预后不良。分析RNA-Seq数据获得815个共同差异基因，其中508个基因上调表达，307个基因下调表达，这些差异基因与细胞粘附和血管生成等功能密切相关。经Western Blot和qRT-PCR验证，成功构建稳定敲低<italic>E2F2</italic>的MM.1S细胞系。敲低<italic>E2F2</italic>显著增加 MM.1S细胞的粘附水平和升高<italic>FN1</italic>、<italic>PECAM1</italic>、<italic>ICOSLG</italic>等细胞粘附相关基因的表达，同时减弱MM.1S细胞迁移侵袭的能力，<italic>P</italic>值均 &lt; 0.05。结论通过对RNA-seq数据的生物信息学分析，我们发现转录因子<italic>E2F2</italic>与骨髓瘤的细胞粘附密切相关，在骨髓瘤MM.1S细胞系中敲低<italic>E2F2</italic>能促进细胞粘附相关基因的表达和增加细胞粘附水平，并抑制细胞迁移能力。
ISSN:1672-3554

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