阿拉善马鹿冬季肠道菌群的多样性

通过高通量测序技术,对采自贺兰山的20只阿拉善马鹿粪便进行测序及菌群多样性分析。结果表明,20个样品共获得1 564 112条序列,有效序列1 399 562条和2 740个OTUs。其中样品包含24个门和283个属,在门水平上核心菌门,分别是厚壁菌门(Firmicutes)76.71%、拟杆菌门(Bacteroidetes)14.16%、变形菌门(Proteobacteria)3.51%。在属水平上,核心菌属有11个,占肠道菌群的31.46%,分别为孢子杆菌属(Sporobacter)7.38%、拟杆菌属(Bacteroides)4.15%、梭菌属系列(Clostridium IV、Clos...

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Main Authors: 李俊乐 1, 高惠 1, 滕丽微 1, 2, 刘振生 1
Format: Article
Language:zho
Published: Editorial Department of Chinese Journal of Wildlife 2020-01-01
Series:野生动物学报
Subjects:
Online Access:http://ysdw.nefu.edu.cn/thesisDetails?columnId=67057744&Fpath=home&index=0
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Description
Summary:通过高通量测序技术,对采自贺兰山的20只阿拉善马鹿粪便进行测序及菌群多样性分析。结果表明,20个样品共获得1 564 112条序列,有效序列1 399 562条和2 740个OTUs。其中样品包含24个门和283个属,在门水平上核心菌门,分别是厚壁菌门(Firmicutes)76.71%、拟杆菌门(Bacteroidetes)14.16%、变形菌门(Proteobacteria)3.51%。在属水平上,核心菌属有11个,占肠道菌群的31.46%,分别为孢子杆菌属(Sporobacter)7.38%、拟杆菌属(Bacteroides)4.15%、梭菌属系列(Clostridium IV、Clostridium XlV)3.63%、罗氏菌属(Roseburia)3.00%、胃瘤球菌(Ruminococcus)1.85%、奥氏杆菌(Oscillibacter)1.80%、Intestinimonas 1.56%、Akkermansia 1.50%、Alistipes 1.49%、Flavonifractor 1.47%。由此可知,阿拉善马鹿肠道菌群复杂多样,为进一步研究阿拉善马鹿肠道菌群功能提供理论依据。
ISSN:2310-1490