构建MS2-RIP方法用于鉴定lncRNA DANCR在肿瘤细胞中的相互作用分子
目的为了探讨lncRNA DANCR在肿瘤细胞中的作用机制，本研究拟构建一种新的MS2-RIP方法用于鉴定DANCR的相互作用分子。方法利用MS2噬菌体衣壳蛋白可与噬菌体复制酶编码基因5’端一段由19个碱基组成的RNA茎环结构序列，即MS2结合位点（MS2 Binding Site，MS2 BS）高效结合的特点，构建串联表达MS2 BS和DANCR的过量表达质粒，通过MS2蛋白与MS2 BS的亲和作用，使DANCR得到富集，并且同步捕获与DANCR相互作用的分子，用于进一步分析鉴定。结果成功构建串联表达MS2 BS和DANCR的过量表达质粒用于MS2-RIP实验，该实验可显著富集DANCR以及...
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| Main Authors: | , , , , |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | zho |
| Published: |
Editorial Office of Journal of Sun Yat-sen University
2021-01-01
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| Series: | Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban |
| Subjects: | |
| Online Access: | http://xuebaoyx.sysu.edu.cn/zh/article/43496293/ |
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|---|---|
| author | 巫孟师 熊敏敏 彭丹 韩雪 钟小敏 |
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| author_sort | 巫孟师 |
| collection | DOAJ |
| description | 目的为了探讨lncRNA DANCR在肿瘤细胞中的作用机制，本研究拟构建一种新的MS2-RIP方法用于鉴定DANCR的相互作用分子。方法利用MS2噬菌体衣壳蛋白可与噬菌体复制酶编码基因5’端一段由19个碱基组成的RNA茎环结构序列，即MS2结合位点（MS2 Binding Site，MS2 BS）高效结合的特点，构建串联表达MS2 BS和DANCR的过量表达质粒，通过MS2蛋白与MS2 BS的亲和作用，使DANCR得到富集，并且同步捕获与DANCR相互作用的分子，用于进一步分析鉴定。结果成功构建串联表达MS2 BS和DANCR的过量表达质粒用于MS2-RIP实验，该实验可显著富集DANCR以及作为阳性对照的DANCR结合蛋白EZH2。结论基于MS2蛋白与MS2结合位点的高效结合特性，我们针对lncRNA DANCR建立了MS2-RIP方法。该方法可有效富集DANCR以及与DANCR结合的生物活性分子，为研究DANCR的作用机制提供一种新的技术手段。 |
| format | Article |
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| institution | Kabale University |
| issn | 1672-3554 |
| language | zho |
| publishDate | 2021-01-01 |
| publisher | Editorial Office of Journal of Sun Yat-sen University |
| record_format | Article |
| series | Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban |
| spelling | doaj-art-7c074e46ab9d44f7ab527fd8d78987902025-01-15T02:34:30ZzhoEditorial Office of Journal of Sun Yat-sen UniversityZhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban1672-35542021-01-0142243243496293构建MS2-RIP方法用于鉴定lncRNA DANCR在肿瘤细胞中的相互作用分子巫孟师熊敏敏彭丹韩雪钟小敏目的为了探讨lncRNA DANCR在肿瘤细胞中的作用机制，本研究拟构建一种新的MS2-RIP方法用于鉴定DANCR的相互作用分子。方法利用MS2噬菌体衣壳蛋白可与噬菌体复制酶编码基因5’端一段由19个碱基组成的RNA茎环结构序列，即MS2结合位点（MS2 Binding Site，MS2 BS）高效结合的特点，构建串联表达MS2 BS和DANCR的过量表达质粒，通过MS2蛋白与MS2 BS的亲和作用，使DANCR得到富集，并且同步捕获与DANCR相互作用的分子，用于进一步分析鉴定。结果成功构建串联表达MS2 BS和DANCR的过量表达质粒用于MS2-RIP实验，该实验可显著富集DANCR以及作为阳性对照的DANCR结合蛋白EZH2。结论基于MS2蛋白与MS2结合位点的高效结合特性，我们针对lncRNA DANCR建立了MS2-RIP方法。该方法可有效富集DANCR以及与DANCR结合的生物活性分子，为研究DANCR的作用机制提供一种新的技术手段。http://xuebaoyx.sysu.edu.cn/zh/article/43496293/MS2RNA结合蛋白免疫沉淀长链非编码RNADANCR |
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