霍乱弧菌新发菌株中<italic>vipA</italic>，<italic>vipB</italic>和<italic>clpV</italic>对T6SS转录调控

霍乱弧菌新发菌株中<italic>vipA</italic>，<italic>vipB</italic>和<italic>clpV</italic>对T6SS转录调控

目的探索霍乱弧菌新发菌株H1的六型分泌系统（T6SS）存在的转录调控机制。方法本研究以转录组测序为基础，分析H1株分别由于<italic>vipA</italic>敲除（H1Δ<italic>vipA</italic>），<italic>vipB</italic>敲除（H1Δ<italic>vipB</italic>）和<italic>clpV</italic>敲除（H1Δ<italic>clpV</italic>）时T6SS基因簇的转录水平，并对其差...

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Bibliographic Details
Main Authors: 吴文轩, 郭扬, 张幸鼎, 赵文婧
Format: Article
Language:zho
Published: Editorial Office of Journal of Sun Yat-sen University 2022-01-01
Series:Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban
Subjects:
六型分泌系统
霍乱弧菌
转录调控
Online Access:http://xuebaoyx.sysu.edu.cn/zh/article/doi/10.13471/j.cnki.j.sun.yat-sen.univ(med.sci).2022.0110/
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Description
Summary:目的探索霍乱弧菌新发菌株H1的六型分泌系统（T6SS）存在的转录调控机制。方法本研究以转录组测序为基础，分析H1株分别由于<italic>vipA</italic>敲除（H1Δ<italic>vipA</italic>），<italic>vipB</italic>敲除（H1Δ<italic>vipB</italic>）和<italic>clpV</italic>敲除（H1Δ<italic>clpV</italic>）时T6SS基因簇的转录水平，并对其差异基因进行了基因本体论（GO）富集和京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集。结果发现H1Δ<italic>vipA</italic>有22个差异基因（FDR&lt;0.01，|log<sub>2</sub>FC|≥1），其中有18个属于T6SS基因簇；并且除<italic>vipA</italic>外，其转录水平均呈上升趋势。结合GO富集和KEGG富集结果，发现<italic>vipA</italic>的缺失会引起与霍乱弧菌群体感应相关基因（<italic>hapR</italic>）的转录水平显著降低。结论我们得出结论<italic>vipA</italic>基因在霍乱弧菌H1菌中是一个具有多重功能的基因，一是编码T6SS鞘结构蛋白，二是参与T6SS调控；推测<italic>hapR</italic>可能参与H1株中<italic>vipA</italic>对T6SS基因簇的转录调控。
ISSN:1672-3554

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