ارزیابی توان مهارکنندگی باکتری های ریزوسفر و اندوفیت بر اروینیا کاراتوورا
سابقه و هدف: باکتری Erwinia carotovora پاتوژن بسیاری از گونه‌های مهم گیاهی بوده و شمار فراوانی از گیاهان زینتی و کشاورزی مانند ذرت، برنج، گوجه فرنگی، پیاز، چغندرقند و نیز سبزیها را آلوده می‌کند. این باکتری یکی از مهمترین عواملی است که با پیدایش پوسیدگی نرم در ساقه و غده سیب‌زمینی پیش و پس از برداشت...
Saved in:
| Main Authors: | , , |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | fas |
| Published: |
Gorgan University of Agricultural Sciences and Natural Resources
2021-08-01
|
| Series: | مدیریت خاک و تولید پایدار |
| Subjects: | |
| Online Access: | https://ejsms.gau.ac.ir/article_5680_2ece8834fff4640f8a1e0c3c87e10a6e.pdf |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| _version_ | 1846145074869567488 |
|---|---|
| author | منیره دینکو آنیا آهنی آذری تینا دادگر |
| author_facet | منیره دینکو آنیا آهنی آذری تینا دادگر |
| author_sort | منیره دینکو |
| collection | DOAJ |
| description | سابقه و هدف: باکتری Erwinia carotovora پاتوژن بسیاری از گونه‌های مهم گیاهی بوده و شمار فراوانی از گیاهان زینتی و کشاورزی مانند ذرت، برنج، گوجه فرنگی، پیاز، چغندرقند و نیز سبزیها را آلوده می‌کند. این باکتری یکی از مهمترین عواملی است که با پیدایش پوسیدگی نرم در ساقه و غده سیب‌زمینی پیش و پس از برداشت تا اندازه فراوانی بازدهی گیاهان را کاهش میدهد. اگرچه این بیماری در بیشتر مناطق سیب‌زمینی‌کاری کشور گزارش شده است اما هنوز یک اقدام مهاری سازگار با محیط زیست برای پیشگیری از این بیماری انجام نشده است. بنابراین شناسایی عوامل زیستی کارا در مهار بیماری پوسیدگی نرم به ویژه در قطب‌های کشاورزی کشور مانند استان گلستان امری ضروری به نظر می‌رسد. بنابراین هدف از انجام این پژوهش جداسازی و شناسایی باکتری-های ریزوسفر و اندوفیت با کارکرد آنتاگونیستی دربرابر E. carotovora در کشتزارهای سیب زمینی روستاهای مرزنکلا و فاضل آباد شهرستان گرگان واقع در استان گلستان بود. مواد و روش‌ها: نمونه های خاک، ریشه، برگ و ساقه سیب زمینی روی محیط نوترینت آگار کشت داده شده و پس از گرماگذاری پرگنه‌های رشدکرده از نظر ریخت شناسی بررسی شدند. پس از ناب‌سازی پرگنه‌ها، در آغاز شناسایی جدایه‌ها با انجام رنگ‌آمیزی گرم و بررسی توانایی ساخت اسپور انجام شد. کارکرد آنتاگونیستی جدایه ها به روش پخش از چاهک در آگار بررسی شد. در این روش پلیت‌ها در دمای اتاق برای 3 تا 5 روز گرماگذاری شده و هاله نبود رشد در پیرامون چاهک‌ها اندازه‌گیری شد. برای بررسی ساخت مادة پادزیست در جدایه های آنتاگونیست از آزمون کلروفورم بهره‌گیری شد. برای شناخت سرشت و زاد مادة پادزیست از آزمون های کاتالاز و حساسیت به پروتئازها بهره‌گیری گردید. سپس پایداری گرمایی مادة پادزیست و اثر pH روی کارکرد مهارکنندگی آن سنجیده شد. جدایه های با کارکرد آنتاگونیستی بیشتر بر پایه تعیین توالی ژن 16S rRNA شناسایی شدند. یافته‌ها: سرهم 42 سویة باکتریایی به ترتیب از ریشه (13)، برگ (7) ساقه (5) و خاک ریزوسفر (17) جدا شد. در میان جدایه‌ها، 33 جدایه گرم مثبت و 9 جدایه گرم منفی بودند. بر پایه نتایج به دست آمده از بررسی کارکرد آنتاگونیستی جدایه‌ها، 8 جدایه دربرابر E. carotovoraکارکرد آنتاگونیستی از خود نشان دادند که همگی باسیل گرم مثبت اسپوردار بوده و جنس باسیلوس بودند. کارکرد مهاری جدایه‌ها با یافته های به دست آمده از آزمون کلروفورم همخوانی داشت. در برابر گواه آزمایش، جدایة با هالة نبود رشد بزرگتر، مادة پادزیست بیشتری ساخت. در آزمون کاتالاز آشکار گردید که سرشت مادة پادزیست ساخته شده در جدایه‌ها پراکسیدئیدروژن ندارد. آنها پس از تیمار با پروتئازها ناکارا شدند که نشان میدهد، سرشت آنها پروتئینی است. توان پادزیستی و مهارکنندگی آبگونه رویی کشتگاه این جدایه ها در دمای 100 درجه سانتی‌گراد از میان رفت و بهترین نشان مهارکنندگی را در pH 7 تا 8 داشتند. جدایه‌هایی که بیشترین کارکرد مهاری را دربرابر E. carotovoraداشتند، بر پایه توالی ژن16S rRNA شناسایی شدند. پس از بررسی توالی نوکلوتیدی آن ژن آشکار شد که این جدایه‌ها به ترتیب بیش از 90 درصد به Bacillus subtilis سویه ZWQ-1 و Bacillus Mycoides سویه 29B-B9 همانندی دارند.نتیجه‌گیری: از آنجایی که در این پژوهش جدایه‌های دارای بهترین نشان مهارکنندگی دربرابر E. carotovora از جنس Bacillus بودند، شاید بتوان از توان بازدارندگی این باکتری‌ها برای مهار زیستی بیماری‌های گیاهی بهره گیری کرد، وانکه برای داوری بهتر در باره کارکرد آنها انجام آزمایش‌‌های بیشتر در گلخانه و کشتزارها پیشنهاد می‌گردد. |
| format | Article |
| id | doaj-art-7130d83de8d64fe7a70efc565fe1af53 |
| institution | Kabale University |
| issn | 2322-1267 2322-1275 |
| language | fas |
| publishDate | 2021-08-01 |
| publisher | Gorgan University of Agricultural Sciences and Natural Resources |
| record_format | Article |
| series | مدیریت خاک و تولید پایدار |
| spelling | doaj-art-7130d83de8d64fe7a70efc565fe1af532024-12-02T06:31:53ZfasGorgan University of Agricultural Sciences and Natural Resourcesمدیریت خاک و تولید پایدار2322-12672322-12752021-08-0111215917010.22069/ejsms.2021.18733.20045680ارزیابی توان مهارکنندگی باکتری های ریزوسفر و اندوفیت بر اروینیا کاراتوورامنیره دینکو0آنیا آهنی آذری1تینا دادگر2دانش آموخته ،کارشناسی ارشد ، گروه میکروبیولوژی، واحد گرگان، دانشگاه آزاد اسلامی، گرگان، ایراناستادیار، گروه میکروبیولوژی، واحد گرگان، دانشگاه آزاد اسلامی، گرگان، ایراناستادیار، گروه میکروبیولوژی، واحد گرگان، دانشگاه آزاد اسلامی، گرگان، ایرانسابقه و هدف: باکتری Erwinia carotovora پاتوژن بسیاری از گونه‌های مهم گیاهی بوده و شمار فراوانی از گیاهان زینتی و کشاورزی مانند ذرت، برنج، گوجه فرنگی، پیاز، چغندرقند و نیز سبزیها را آلوده می‌کند. این باکتری یکی از مهمترین عواملی است که با پیدایش پوسیدگی نرم در ساقه و غده سیب‌زمینی پیش و پس از برداشت تا اندازه فراوانی بازدهی گیاهان را کاهش میدهد. اگرچه این بیماری در بیشتر مناطق سیب‌زمینی‌کاری کشور گزارش شده است اما هنوز یک اقدام مهاری سازگار با محیط زیست برای پیشگیری از این بیماری انجام نشده است. بنابراین شناسایی عوامل زیستی کارا در مهار بیماری پوسیدگی نرم به ویژه در قطب‌های کشاورزی کشور مانند استان گلستان امری ضروری به نظر می‌رسد. بنابراین هدف از انجام این پژوهش جداسازی و شناسایی باکتری-های ریزوسفر و اندوفیت با کارکرد آنتاگونیستی دربرابر E. carotovora در کشتزارهای سیب زمینی روستاهای مرزنکلا و فاضل آباد شهرستان گرگان واقع در استان گلستان بود. مواد و روش‌ها: نمونه های خاک، ریشه، برگ و ساقه سیب زمینی روی محیط نوترینت آگار کشت داده شده و پس از گرماگذاری پرگنه‌های رشدکرده از نظر ریخت شناسی بررسی شدند. پس از ناب‌سازی پرگنه‌ها، در آغاز شناسایی جدایه‌ها با انجام رنگ‌آمیزی گرم و بررسی توانایی ساخت اسپور انجام شد. کارکرد آنتاگونیستی جدایه ها به روش پخش از چاهک در آگار بررسی شد. در این روش پلیت‌ها در دمای اتاق برای 3 تا 5 روز گرماگذاری شده و هاله نبود رشد در پیرامون چاهک‌ها اندازه‌گیری شد. برای بررسی ساخت مادة پادزیست در جدایه های آنتاگونیست از آزمون کلروفورم بهره‌گیری شد. برای شناخت سرشت و زاد مادة پادزیست از آزمون های کاتالاز و حساسیت به پروتئازها بهره‌گیری گردید. سپس پایداری گرمایی مادة پادزیست و اثر pH روی کارکرد مهارکنندگی آن سنجیده شد. جدایه های با کارکرد آنتاگونیستی بیشتر بر پایه تعیین توالی ژن 16S rRNA شناسایی شدند. یافته‌ها: سرهم 42 سویة باکتریایی به ترتیب از ریشه (13)، برگ (7) ساقه (5) و خاک ریزوسفر (17) جدا شد. در میان جدایه‌ها، 33 جدایه گرم مثبت و 9 جدایه گرم منفی بودند. بر پایه نتایج به دست آمده از بررسی کارکرد آنتاگونیستی جدایه‌ها، 8 جدایه دربرابر E. carotovoraکارکرد آنتاگونیستی از خود نشان دادند که همگی باسیل گرم مثبت اسپوردار بوده و جنس باسیلوس بودند. کارکرد مهاری جدایه‌ها با یافته های به دست آمده از آزمون کلروفورم همخوانی داشت. در برابر گواه آزمایش، جدایة با هالة نبود رشد بزرگتر، مادة پادزیست بیشتری ساخت. در آزمون کاتالاز آشکار گردید که سرشت مادة پادزیست ساخته شده در جدایه‌ها پراکسیدئیدروژن ندارد. آنها پس از تیمار با پروتئازها ناکارا شدند که نشان میدهد، سرشت آنها پروتئینی است. توان پادزیستی و مهارکنندگی آبگونه رویی کشتگاه این جدایه ها در دمای 100 درجه سانتی‌گراد از میان رفت و بهترین نشان مهارکنندگی را در pH 7 تا 8 داشتند. جدایه‌هایی که بیشترین کارکرد مهاری را دربرابر E. carotovoraداشتند، بر پایه توالی ژن16S rRNA شناسایی شدند. پس از بررسی توالی نوکلوتیدی آن ژن آشکار شد که این جدایه‌ها به ترتیب بیش از 90 درصد به Bacillus subtilis سویه ZWQ-1 و Bacillus Mycoides سویه 29B-B9 همانندی دارند.نتیجه‌گیری: از آنجایی که در این پژوهش جدایه‌های دارای بهترین نشان مهارکنندگی دربرابر E. carotovora از جنس Bacillus بودند، شاید بتوان از توان بازدارندگی این باکتری‌ها برای مهار زیستی بیماری‌های گیاهی بهره گیری کرد، وانکه برای داوری بهتر در باره کارکرد آنها انجام آزمایش‌‌های بیشتر در گلخانه و کشتزارها پیشنهاد می‌گردد.https://ejsms.gau.ac.ir/article_5680_2ece8834fff4640f8a1e0c3c87e10a6e.pdfاروینیاکاراتووراپوسیدگی نرمآنتاگونیستآندوفیتریزوسفر |
| spellingShingle | منیره دینکو آنیا آهنی آذری تینا دادگر ارزیابی توان مهارکنندگی باکتری های ریزوسفر و اندوفیت بر اروینیا کاراتوورا مدیریت خاک و تولید پایدار اروینیاکاراتوورا پوسیدگی نرم آنتاگونیست آندوفیت ریزوسفر |
| title | ارزیابی توان مهارکنندگی باکتری های ریزوسفر و اندوفیت بر اروینیا کاراتوورا |
| title_full | ارزیابی توان مهارکنندگی باکتری های ریزوسفر و اندوفیت بر اروینیا کاراتوورا |
| title_fullStr | ارزیابی توان مهارکنندگی باکتری های ریزوسفر و اندوفیت بر اروینیا کاراتوورا |
| title_full_unstemmed | ارزیابی توان مهارکنندگی باکتری های ریزوسفر و اندوفیت بر اروینیا کاراتوورا |
| title_short | ارزیابی توان مهارکنندگی باکتری های ریزوسفر و اندوفیت بر اروینیا کاراتوورا |
| title_sort | ارزیابی توان مهارکنندگی باکتری های ریزوسفر و اندوفیت بر اروینیا کاراتوورا |
| topic | اروینیاکاراتوورا پوسیدگی نرم آنتاگونیست آندوفیت ریزوسفر |
| url | https://ejsms.gau.ac.ir/article_5680_2ece8834fff4640f8a1e0c3c87e10a6e.pdf |
| work_keys_str_mv | AT mnyrhdynḵw ạrzyạbytwạnmhạrḵnndgybạḵtryhạyryzwsfrwạndwfytbrạrwynyạḵạrạtwwrạ AT ậnyạậhnyậdẖry ạrzyạbytwạnmhạrḵnndgybạḵtryhạyryzwsfrwạndwfytbrạrwynyạḵạrạtwwrạ AT tynạdạdgr ạrzyạbytwạnmhạrḵnndgybạḵtryhạyryzwsfrwạndwfytbrạrwynyạḵạrạtwwrạ |