基于生物信息学途径食管鳞癌lncRNA预后风险模型的构建
目的基于癌症基因组图谱（TCGA）数据库食管鳞癌lncRNA差异表达，构建食管鳞癌预后风险模型。方法从TCGA肿瘤数据库下载食管鳞癌基因表达数据及临床信息，使用R 4.0.3软件提取差异表达lncRNA，进一步使用COX回归分析筛选模型lncRNA，并构建预后风险模型Riskscore；按照风险评分中位值将食管鳞癌患者分为低风险组和高风险组，进一步比较高低风险组生存预后；分析比较风险模型及其他临床特征对食管鳞癌生存预后的预测性能；分析风险评分与其他临床特征相关性；采用主成分分析（PCA）及基因富集分析（GSEA）探索高低风险组基因分布差异。结果得到差异表达lncRNA174个，食管鳞癌组织表达...
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| Main Authors: | , , , |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | zho |
| Published: |
Editorial Office of Journal of Sun Yat-sen University
2021-09-01
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| Series: | Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban |
| Subjects: | |
| Online Access: | http://xuebaoyx.sysu.edu.cn/zh/article/doi/10.13471/j.cnki.j.sun.yat-sen.univ(med.sci).2021.0511/ |
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