圈养梅花鹿肠道菌群组成的性别差异
为探究圈养梅花鹿（<italic>Cervus nippon</italic>）肠道菌群的结构、多样性以及肠道菌群组成的性别差异，利用Illumina MiSeq高通量测序平台对10只圈养健康梅花鹿粪便中的细菌16S rRNA V3—V4区扩增子进行PCR扩增，采用生物信息学手段以性别作为分组因素，分析雄、雌圈养梅花鹿肠道菌群的结构、多样性和差异物种。结果显示：在门水平上，圈养梅花鹿肠道菌群的优势菌门为厚壁菌门（Firmicutes；雄性61.69%，雌性58.23%）和拟杆菌门（Bacteroidetes；雄性27.40%，雌性31.19%）；在属水平上，优势菌属为拟...
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| Main Authors: | , , , , , , , |
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| Format: | Article |
| Language: | zho |
| Published: |
Editorial Department of Chinese Journal of Wildlife
2023-05-01
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| Series: | 野生动物学报 |
| Subjects: | |
| Online Access: | http://ysdw.nefu.edu.cn/thesisDetails#10.12375/ysdwxb.20230212 |
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| author | 史倍宁 赵耀 林子涵 田佳欣 孙嘉 马雅雯 刘振生 滕丽微 |
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| description | 为探究圈养梅花鹿（<italic>Cervus nippon</italic>）肠道菌群的结构、多样性以及肠道菌群组成的性别差异，利用Illumina MiSeq高通量测序平台对10只圈养健康梅花鹿粪便中的细菌16S rRNA V3—V4区扩增子进行PCR扩增，采用生物信息学手段以性别作为分组因素，分析雄、雌圈养梅花鹿肠道菌群的结构、多样性和差异物种。结果显示：在门水平上，圈养梅花鹿肠道菌群的优势菌门为厚壁菌门（Firmicutes；雄性61.69%，雌性58.23%）和拟杆菌门（Bacteroidetes；雄性27.40%，雌性31.19%）；在属水平上，优势菌属为拟杆菌属（<italic>Bacteroides</italic>；雄性4.60%，雌性6.13%）和梭菌属（<italic>Clostridium_IV</italic>； 雄性3.42%，雌性3.25%）。雄、雌圈养梅花鹿肠道菌群的<italic>α</italic>多样性无显著差异 （<italic>p</italic>>0.05）。<italic>β</italic>多样性分析表明，不同性别梅花鹿的肠道菌群组成相似度较高，且组间不存在显著差异（<italic>p</italic>>0.05）。STAMP和LEfSe分析表明，雌性圈养梅花鹿中起重要作用的菌群为拟杆菌门（LDA值>4，<italic>p<</italic>0.05）。研究表明，圈养梅花鹿肠道菌群结构及多样性性别间无显著差异，但雄、雌梅花鹿肠道中个别菌门、菌属的分布存在一定差异，拟杆菌门受宿主性别影响较大。 |
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| institution | Kabale University |
| issn | 2310-1490 |
| language | zho |
| publishDate | 2023-05-01 |
| publisher | Editorial Department of Chinese Journal of Wildlife |
| record_format | Article |
| series | 野生动物学报 |
| spelling | doaj-art-4a9065d76d1843c1a8cdef8d5bd886112025-01-14T04:06:39ZzhoEditorial Department of Chinese Journal of Wildlife野生动物学报2310-14902023-05-014433033837490743圈养梅花鹿肠道菌群组成的性别差异史倍宁赵耀林子涵田佳欣孙嘉马雅雯刘振生滕丽微为探究圈养梅花鹿（<italic>Cervus nippon</italic>）肠道菌群的结构、多样性以及肠道菌群组成的性别差异，利用Illumina MiSeq高通量测序平台对10只圈养健康梅花鹿粪便中的细菌16S rRNA V3—V4区扩增子进行PCR扩增，采用生物信息学手段以性别作为分组因素，分析雄、雌圈养梅花鹿肠道菌群的结构、多样性和差异物种。结果显示：在门水平上，圈养梅花鹿肠道菌群的优势菌门为厚壁菌门（Firmicutes；雄性61.69%，雌性58.23%）和拟杆菌门（Bacteroidetes；雄性27.40%，雌性31.19%）；在属水平上，优势菌属为拟杆菌属（<italic>Bacteroides</italic>；雄性4.60%，雌性6.13%）和梭菌属（<italic>Clostridium_IV</italic>； 雄性3.42%，雌性3.25%）。雄、雌圈养梅花鹿肠道菌群的<italic>α</italic>多样性无显著差异 （<italic>p</italic>>0.05）。<italic>β</italic>多样性分析表明，不同性别梅花鹿的肠道菌群组成相似度较高，且组间不存在显著差异（<italic>p</italic>>0.05）。STAMP和LEfSe分析表明，雌性圈养梅花鹿中起重要作用的菌群为拟杆菌门（LDA值>4，<italic>p<</italic>0.05）。研究表明，圈养梅花鹿肠道菌群结构及多样性性别间无显著差异，但雄、雌梅花鹿肠道中个别菌门、菌属的分布存在一定差异，拟杆菌门受宿主性别影响较大。http://ysdw.nefu.edu.cn/thesisDetails#10.12375/ysdwxb.20230212肠道菌群梅花鹿圈养性别 |
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