基于微卫星复合扩增的马来穿山甲个体识别研究

基于微卫星复合扩增的马来穿山甲个体识别研究

利用12个微卫星位点复合扩增构建马来穿山甲(<i>Manis javanica</i>)个体识别体系,评估其种群遗传多样性和遗传结构。结果显示:重构的个体识别体系累积无关个体基因型匹配概率(<i>P</i><sub>(ID)</sub>)和同胞个体基因型匹配概率(<i>P</i><sub>(ID)sibs</sub>)分别为6.48×10<sup>-16</sup>和9.65×10<sup>-6</sup>,具有较高的鉴别力和灵...

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Main Authors: 李嘉昊, 王 辰, 雷 行, 逯金瑶, 李 立, 李 波
Format: Article
Language:zho
Published: Editorial Department of Chinese Journal of Wildlife 2022-01-01
Series:野生动物学报
Subjects:
个体识别
马来穿山甲
微卫星标记
遗传多样性和遗传结构
Online Access:http://ysdw.nefu.edu.cn/thesisDetails#10.12375/ysdwxb.20220406
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Description
Summary:利用12个微卫星位点复合扩增构建马来穿山甲(<i>Manis javanica</i>)个体识别体系,评估其种群遗传多样性和遗传结构。结果显示:重构的个体识别体系累积无关个体基因型匹配概率(<i>P</i><sub>(ID)</sub>)和同胞个体基因型匹配概率(<i>P</i><sub>(ID)sibs</sub>)分别为6.48×10<sup>-16</sup>和9.65×10<sup>-6</sup>,具有较高的鉴别力和灵敏度。在135只马来穿山甲个体上共检测出155个等位基因,多态信息含量(PIC)为0.733,平均等位基因数(<i>N</i><sub>a</sub>)为12.91,平均观测杂合度(<i>H</i><sub>o</sub>)为0.631,平均期望杂合度(<i>H</i><sub>e</sub>)为0.756,在鲮鲤科(Manidae)内处于高水平。聚类分析显示样本集分为3个种群,具有显著的遗传结构。重构的马来穿山甲个体识别体系具有可靠性强、成本低、物种特异性,以及准确率和灵敏度高等优点,适用于多种类型检材。同时,该体系可用于评估马来穿山甲种群遗传多样性水平和遗传结构。
ISSN:2310-1490

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