基于16S rRNA基因对濒危脊椎动物鉴定的可行性
为探索16S rRNA基因条形码技术在濒危脊椎动物物种鉴定中的可行性,选取脊椎动物线粒体16S rRNA基因中长度为286 bp的片段设计通用引物,以哺乳纲(Mammalia)、爬行纲(Reptilia)、两栖纲(Amphibia)、软骨鱼纲(Chondrichthyes)和辐鳍鱼纲(Actinopterygii)中24科、28属、40种共71个濒危脊椎动物样本为研究对象,进行PCR扩增并对扩增产物进行纯化、测序和基因序列分析。结果显示:建立的检测方法灵敏度可以达0.001 ng/μL,其中62个(39个物种)样本扩增成功,57个样本(34个物种)测序结果与GenBank数据库中的参考序列具有...
Saved in:
Main Author: | |
---|---|
Format: | Article |
Language: | zho |
Published: |
Editorial Department of Chinese Journal of Wildlife
2022-01-01
|
Series: | 野生动物学报 |
Subjects: | |
Online Access: | http://ysdw.nefu.edu.cn/thesisDetails?columnId=67056165&Fpath=home&index=0 |
Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
_version_ | 1841542330184630272 |
---|---|
author | 蒋晓霞 1 徐博文 1 李伟刚 1 邵建宏 1 周傲白雪 1 唐泰山 2 赵福振 1 苗丽 3 黄海超 1 罗宝正 1 |
author_facet | 蒋晓霞 1 徐博文 1 李伟刚 1 邵建宏 1 周傲白雪 1 唐泰山 2 赵福振 1 苗丽 3 黄海超 1 罗宝正 1 |
author_sort | 蒋晓霞 1 徐博文 1 李伟刚 1 邵建宏 1 周傲白雪 1 唐泰山 2 赵福振 1 苗丽 3 黄海超 1 罗宝正 1 |
collection | DOAJ |
description | 为探索16S rRNA基因条形码技术在濒危脊椎动物物种鉴定中的可行性,选取脊椎动物线粒体16S rRNA基因中长度为286 bp的片段设计通用引物,以哺乳纲(Mammalia)、爬行纲(Reptilia)、两栖纲(Amphibia)、软骨鱼纲(Chondrichthyes)和辐鳍鱼纲(Actinopterygii)中24科、28属、40种共71个濒危脊椎动物样本为研究对象,进行PCR扩增并对扩增产物进行纯化、测序和基因序列分析。结果显示:建立的检测方法灵敏度可以达0.001 ng/μL,其中62个(39个物种)样本扩增成功,57个样本(34个物种)测序结果与GenBank数据库中的参考序列具有较高相似度,可以鉴定到种的水平。测序所得的基因序列与参考序列的种内遗传距离为0~0.5%、种间遗传距离为1.0%~39.9%,最小种间遗传距离大于最大种内遗传距离,即存在明显的条形码间隔;另外5个样本(5个物种)测序结果在属内种间高度一致,只能鉴定到属的水平。基于16S rRNA基因片段构建的条形码可对濒危脊椎动物进行种属鉴定,可为濒危物种保护、打击非法走私等提供技术支撑。 |
format | Article |
id | doaj-art-39d07d36f1534bb48858c59e6ba67cb9 |
institution | Kabale University |
issn | 2310-1490 |
language | zho |
publishDate | 2022-01-01 |
publisher | Editorial Department of Chinese Journal of Wildlife |
record_format | Article |
series | 野生动物学报 |
spelling | doaj-art-39d07d36f1534bb48858c59e6ba67cb92025-01-14T04:12:32ZzhoEditorial Department of Chinese Journal of Wildlife野生动物学报2310-14902022-01-01515767056165基于16S rRNA基因对濒危脊椎动物鉴定的可行性蒋晓霞 1 徐博文 1 李伟刚 1 邵建宏 1 周傲白雪 1 唐泰山 2 赵福振 1 苗丽 3 黄海超 1 罗宝正 1为探索16S rRNA基因条形码技术在濒危脊椎动物物种鉴定中的可行性,选取脊椎动物线粒体16S rRNA基因中长度为286 bp的片段设计通用引物,以哺乳纲(Mammalia)、爬行纲(Reptilia)、两栖纲(Amphibia)、软骨鱼纲(Chondrichthyes)和辐鳍鱼纲(Actinopterygii)中24科、28属、40种共71个濒危脊椎动物样本为研究对象,进行PCR扩增并对扩增产物进行纯化、测序和基因序列分析。结果显示:建立的检测方法灵敏度可以达0.001 ng/μL,其中62个(39个物种)样本扩增成功,57个样本(34个物种)测序结果与GenBank数据库中的参考序列具有较高相似度,可以鉴定到种的水平。测序所得的基因序列与参考序列的种内遗传距离为0~0.5%、种间遗传距离为1.0%~39.9%,最小种间遗传距离大于最大种内遗传距离,即存在明显的条形码间隔;另外5个样本(5个物种)测序结果在属内种间高度一致,只能鉴定到属的水平。基于16S rRNA基因片段构建的条形码可对濒危脊椎动物进行种属鉴定,可为濒危物种保护、打击非法走私等提供技术支撑。http://ysdw.nefu.edu.cn/thesisDetails?columnId=67056165&Fpath=home&index=0濒危脊椎动物16S rRNA种属鉴定 |
spellingShingle | 蒋晓霞 1 徐博文 1 李伟刚 1 邵建宏 1 周傲白雪 1 唐泰山 2 赵福振 1 苗丽 3 黄海超 1 罗宝正 1 基于16S rRNA基因对濒危脊椎动物鉴定的可行性 野生动物学报 濒危脊椎动物 16S rRNA 种属鉴定 |
title | 基于16S rRNA基因对濒危脊椎动物鉴定的可行性 |
title_full | 基于16S rRNA基因对濒危脊椎动物鉴定的可行性 |
title_fullStr | 基于16S rRNA基因对濒危脊椎动物鉴定的可行性 |
title_full_unstemmed | 基于16S rRNA基因对濒危脊椎动物鉴定的可行性 |
title_short | 基于16S rRNA基因对濒危脊椎动物鉴定的可行性 |
title_sort | 基于16s rrna基因对濒危脊椎动物鉴定的可行性 |
topic | 濒危脊椎动物 16S rRNA 种属鉴定 |
url | http://ysdw.nefu.edu.cn/thesisDetails?columnId=67056165&Fpath=home&index=0 |
work_keys_str_mv | AT jiǎngxiǎoxiá1xúbówén1lǐwěigāng1shàojiànhóng1zhōuàobáixuě1tángtàishān2zhàofúzhèn1miáolì3huánghǎichāo1luōbǎozhèng1 jīyú16srrnajīyīnduìbīnwēijíchuídòngwùjiàndìngdekěxíngxìng |