基于COI条码探讨天鹅的系统进化关系
COI基因具有突变速度快、容易被扩增、进化速率适中等特点,已被广泛应用于动物分类、鉴别及进化关系研究中。该研究以线粒体DNA的COI基因作为分子标记,对鸭科雁亚科天鹅属中大天鹅、小天鹅、疣鼻天鹅和黑天鹅4种天鹅的COI基因的部分序列进行了测序,得到38条COI基因序列。结合从NCBI和BLOD基因库中下载的天鹅的COI基因进行序列比对和分析,其中3个单倍型为该实验新获得。以栗树鸭为外群,使用ME法(minimum-evolution)和NJ法(neighbor-joining)构建天鹅COI基因的系统发育树,其拓扑结构基本一致:扁嘴天鹅最先分化出来,黑颈天鹅、疣鼻天鹅和黑天鹅聚为一支,大天鹅、...
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| Main Author: | |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | zho |
| Published: |
Editorial Department of Chinese Journal of Wildlife
2015-01-01
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| Series: | 野生动物学报 |
| Subjects: | |
| Online Access: | http://ysdw.nefu.edu.cn/thesisDetails?columnId=67069556&Fpath=home&index=0 |
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| author | 王 烨 白素英 周其俊 田秀华 庞 雪 杨 越 |
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| description | COI基因具有突变速度快、容易被扩增、进化速率适中等特点,已被广泛应用于动物分类、鉴别及进化关系研究中。该研究以线粒体DNA的COI基因作为分子标记,对鸭科雁亚科天鹅属中大天鹅、小天鹅、疣鼻天鹅和黑天鹅4种天鹅的COI基因的部分序列进行了测序,得到38条COI基因序列。结合从NCBI和BLOD基因库中下载的天鹅的COI基因进行序列比对和分析,其中3个单倍型为该实验新获得。以栗树鸭为外群,使用ME法(minimum-evolution)和NJ法(neighbor-joining)构建天鹅COI基因的系统发育树,其拓扑结构基本一致:扁嘴天鹅最先分化出来,黑颈天鹅、疣鼻天鹅和黑天鹅聚为一支,大天鹅、小天鹅和黑颈天鹅为另一支,与传统分类观点一致。 |
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| institution | Kabale University |
| issn | 2310-1490 |
| language | zho |
| publishDate | 2015-01-01 |
| publisher | Editorial Department of Chinese Journal of Wildlife |
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