食管鳞癌患者唾液菌群的研究
【目的】分析食管鳞癌患者(ESCC组)与健康对照组(HC组)唾液菌群多样性,筛选出食管鳞癌患者唾液中特异性细菌。【方法】收集50例食管鳞癌患者和40例健康对照者的唾液标本,提取总DNA,用PCR扩增16SrDNAV4区,进行高通量测序,将测序数据进行OUT聚类,物种注释及多样性分析。【结果】多样性分析表明ESCC组和HC组整体唾液菌群的多样性及组成方面存在差异(但>0.05),物种分析表明ESCC组以奈瑟菌属(Neisseria)、梭杆菌属(Fusobacterium)、嗜血杆菌属(Haemophilus)、普式菌属(Prevotella)、卟啉单胞菌属(Porphyromonas)为主...
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Main Authors: | , , , , , , , |
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Format: | Article |
Language: | zho |
Published: |
Editorial Office of Journal of Sun Yat-sen University
2020-01-01
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Series: | Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban |
Subjects: | |
Online Access: | http://xuebaoyx.sysu.edu.cn/zh/article/44095453/ |
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Summary: | 【目的】分析食管鳞癌患者(ESCC组)与健康对照组(HC组)唾液菌群多样性,筛选出食管鳞癌患者唾液中特异性细菌。【方法】收集50例食管鳞癌患者和40例健康对照者的唾液标本,提取总DNA,用PCR扩增16SrDNAV4区,进行高通量测序,将测序数据进行OUT聚类,物种注释及多样性分析。【结果】多样性分析表明ESCC组和HC组整体唾液菌群的多样性及组成方面存在差异(但>0.05),物种分析表明ESCC组以奈瑟菌属(Neisseria)、梭杆菌属(Fusobacterium)、嗜血杆菌属(Haemophilus)、普式菌属(Prevotella)、卟啉单胞菌属(Porphyromonas)为主,健康对照组以奈瑟菌属(Neisseria)、嗜血杆菌属(Haemophilus)、普式菌属(Prevotella)、梭杆菌属(Fusobacterium)、韦荣氏球菌属(Veillonella)为主,LEfSe分析表明ESCC组卟啉菌属表达升高,且具有统计学差异(<0.05)。【结论】食管癌患者唾液有其特征性的菌群组成,与健康对照组相比,食管鳞癌患者唾液中卟啉菌属表达明显升高,是特征性表达的细菌。 |
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ISSN: | 1672-3554 |