一株野鸟源重组禽流感（H6N1）病毒基因组分子特征分析
2017年在江苏省野生豆雁粪便中分离得到1株H6N1亚型禽流感病毒A/Anser fabalis/Jiangsu/J746/2017（H6N1）（J746）。本研究对J746进行了全基因组测序，并对其进行了遗传进化分析。遗传进化分析结果表明：与HA和NA基因同源性最高的毒株为A/wild waterfowl/Korea/F14-5/2016（H6N1），同源性为99.4%。HA基因与流行于韩国、日本和孟加拉的N1、N2、N8亚型毒株处于同一分支，NA基因与韩国野生水禽的H6、H7亚型毒株处于同一分支，PB2基因与中亚及东亚地区低致性病毒株处于同一分支，PB1基因和NP基因与流行在东南亚的低致病...
Saved in:
| Main Authors: | , , , , , , , , , |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | zho |
| Published: |
Editorial Department of Chinese Journal of Wildlife
2020-01-01
|
| Series: | 野生动物学报 |
| Subjects: | |
| Online Access: | http://ysdw.nefu.edu.cn/thesisDetails?columnId=67056066&Fpath=home&index=0 |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| _version_ | 1841542203323711488 |
|---|---|
| author | 杨晓宇 1 孙静 1 吕欣孺 1 李祥 1 陈丽霞 2 付恬 1 马天 2 马沛然 1 李仪 1 王玉龙 1 |
| author_facet | 杨晓宇 1 孙静 1 吕欣孺 1 李祥 1 陈丽霞 2 付恬 1 马天 2 马沛然 1 李仪 1 王玉龙 1 |
| author_sort | 杨晓宇 1 |
| collection | DOAJ |
| description | 2017年在江苏省野生豆雁粪便中分离得到1株H6N1亚型禽流感病毒A/Anser fabalis/Jiangsu/J746/2017（H6N1）（J746）。本研究对J746进行了全基因组测序，并对其进行了遗传进化分析。遗传进化分析结果表明：与HA和NA基因同源性最高的毒株为A/wild waterfowl/Korea/F14-5/2016（H6N1），同源性为99.4%。HA基因与流行于韩国、日本和孟加拉的N1、N2、N8亚型毒株处于同一分支，NA基因与韩国野生水禽的H6、H7亚型毒株处于同一分支，PB2基因与中亚及东亚地区低致性病毒株处于同一分支，PB1基因和NP基因与流行在东南亚的低致病性毒株处于同一分支，PA基因和M基因均处于欧亚分支，但PA形成了独立的小分支，NS基因与分离于中国中南部和日本的毒株聚集在一起。氨基酸位点分析表明，神经氨酸（NA）蛋白存在H274Y突变，该突变可增强病毒对神经氨酸酶抑制剂药物的耐药性；同时在PB2蛋白中发现与增强对小鼠致病性有关的L89V突变，在NS1蛋白中发现与增强对小鼠致病性、提高复制能力和改变宿主嗜性有关的P42S、L103F、I106M、N205S突变。综上所述，J746毒株基因组构成来源复杂，是由多个国家和地区形成的一株多元重组病毒。 |
| format | Article |
| id | doaj-art-1e11d4ad8adc49e4a98f3e55b483871b |
| institution | Kabale University |
| issn | 2310-1490 |
| language | zho |
| publishDate | 2020-01-01 |
| publisher | Editorial Department of Chinese Journal of Wildlife |
| record_format | Article |
| series | 野生动物学报 |
| spelling | doaj-art-1e11d4ad8adc49e4a98f3e55b483871b2025-01-14T04:15:01ZzhoEditorial Department of Chinese Journal of Wildlife野生动物学报2310-14902020-01-0145146467056066一株野鸟源重组禽流感（H6N1）病毒基因组分子特征分析杨晓宇 1孙静 1吕欣孺 1李祥 1陈丽霞 2付恬 1马天 2马沛然 1李仪 1王玉龙 12017年在江苏省野生豆雁粪便中分离得到1株H6N1亚型禽流感病毒A/Anser fabalis/Jiangsu/J746/2017（H6N1）（J746）。本研究对J746进行了全基因组测序，并对其进行了遗传进化分析。遗传进化分析结果表明：与HA和NA基因同源性最高的毒株为A/wild waterfowl/Korea/F14-5/2016（H6N1），同源性为99.4%。HA基因与流行于韩国、日本和孟加拉的N1、N2、N8亚型毒株处于同一分支，NA基因与韩国野生水禽的H6、H7亚型毒株处于同一分支，PB2基因与中亚及东亚地区低致性病毒株处于同一分支，PB1基因和NP基因与流行在东南亚的低致病性毒株处于同一分支，PA基因和M基因均处于欧亚分支，但PA形成了独立的小分支，NS基因与分离于中国中南部和日本的毒株聚集在一起。氨基酸位点分析表明，神经氨酸（NA）蛋白存在H274Y突变，该突变可增强病毒对神经氨酸酶抑制剂药物的耐药性；同时在PB2蛋白中发现与增强对小鼠致病性有关的L89V突变，在NS1蛋白中发现与增强对小鼠致病性、提高复制能力和改变宿主嗜性有关的P42S、L103F、I106M、N205S突变。综上所述，J746毒株基因组构成来源复杂，是由多个国家和地区形成的一株多元重组病毒。http://ysdw.nefu.edu.cn/thesisDetails?columnId=67056066&Fpath=home&index=0禽流感病毒H6N1序列分析 |
| spellingShingle | 杨晓宇 1 孙静 1 吕欣孺 1 李祥 1 陈丽霞 2 付恬 1 马天 2 马沛然 1 李仪 1 王玉龙 1 一株野鸟源重组禽流感（H6N1）病毒基因组分子特征分析 野生动物学报 禽流感病毒 H6N1 序列分析 |
| title | 一株野鸟源重组禽流感（H6N1）病毒基因组分子特征分析 |
| title_full | 一株野鸟源重组禽流感（H6N1）病毒基因组分子特征分析 |
| title_fullStr | 一株野鸟源重组禽流感（H6N1）病毒基因组分子特征分析 |
| title_full_unstemmed | 一株野鸟源重组禽流感（H6N1）病毒基因组分子特征分析 |
| title_short | 一株野鸟源重组禽流感（H6N1）病毒基因组分子特征分析 |
| title_sort | 一株野鸟源重组禽流感 h6n1 病毒基因组分子特征分析 |
| topic | 禽流感病毒 H6N1 序列分析 |
| url | http://ysdw.nefu.edu.cn/thesisDetails?columnId=67056066&Fpath=home&index=0 |
| work_keys_str_mv | AT yángxiǎoyǔ1 yīzhūyěniǎoyuánzhòngzǔqínliúgǎnh6n1bìngdújīyīnzǔfēnzitèzhēngfēnxī AT sūnjìng1 yīzhūyěniǎoyuánzhòngzǔqínliúgǎnh6n1bìngdújīyīnzǔfēnzitèzhēngfēnxī AT lǚxīnrú1 yīzhūyěniǎoyuánzhòngzǔqínliúgǎnh6n1bìngdújīyīnzǔfēnzitèzhēngfēnxī AT lǐxiáng1 yīzhūyěniǎoyuánzhòngzǔqínliúgǎnh6n1bìngdújīyīnzǔfēnzitèzhēngfēnxī AT chénlìxiá2 yīzhūyěniǎoyuánzhòngzǔqínliúgǎnh6n1bìngdújīyīnzǔfēnzitèzhēngfēnxī AT fùtián1 yīzhūyěniǎoyuánzhòngzǔqínliúgǎnh6n1bìngdújīyīnzǔfēnzitèzhēngfēnxī AT mǎtiān2 yīzhūyěniǎoyuánzhòngzǔqínliúgǎnh6n1bìngdújīyīnzǔfēnzitèzhēngfēnxī AT mǎpèirán1 yīzhūyěniǎoyuánzhòngzǔqínliúgǎnh6n1bìngdújīyīnzǔfēnzitèzhēngfēnxī AT lǐyí1 yīzhūyěniǎoyuánzhòngzǔqínliúgǎnh6n1bìngdújīyīnzǔfēnzitèzhēngfēnxī AT wángyùlóng1 yīzhūyěniǎoyuánzhòngzǔqínliúgǎnh6n1bìngdújīyīnzǔfēnzitèzhēngfēnxī |