急性髓系白血病新型预后分子标志物<italic>NKX2-3</italic>的发现

急性髓系白血病新型预后分子标志物<italic>NKX2-3</italic>的发现

目的通过分析生物信息数据库中影响急性髓系白血病（AML）患者的预后的分子标志物的表达，为进一步探索AML预后的新型分子标志物提供实验基础。方法从癌症基因组图谱（TCGA）生物信息数据库中的179例AML患者的预后数据进行差异性基因分析及生存分析；利用基因表达集锦（GEO）数据库中的GSE13159数据集的74例健康人（HI）骨髓标本与542例AML初发患者骨髓标本进行分析，检测差异性目的基因表达水平在AML初发患者与健康人中的差异性；收集初发18例AML患者的外周血及骨髓样本，同时收集年龄和性别匹配的20例健康志愿者的样本作为对照，采用实时荧光定量PCR验证差异基因在AML患者体内的表达水平。...

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Main Authors: 王婉頔, 常桃, 江思远, 侯琪, 金真伊, 吴秀丽
Format: Article
Language:zho
Published: Editorial Office of Journal of Sun Yat-sen University 2024-01-01
Series:Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban
Subjects:
急性髓系白血病
<italic>NKX2-3</italic>
生物信息学
预后
基因表达
相关性
Online Access:http://xuebaoyx.sysu.edu.cn/zh/article/doi/10.13471/j.cnki.j.sun.yat-sen.univ(med.sci).20240004.014/
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author 王婉頔
常桃
江思远
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description 目的通过分析生物信息数据库中影响急性髓系白血病（AML）患者的预后的分子标志物的表达，为进一步探索AML预后的新型分子标志物提供实验基础。方法从癌症基因组图谱（TCGA）生物信息数据库中的179例AML患者的预后数据进行差异性基因分析及生存分析；利用基因表达集锦（GEO）数据库中的GSE13159数据集的74例健康人（HI）骨髓标本与542例AML初发患者骨髓标本进行分析，检测差异性目的基因表达水平在AML初发患者与健康人中的差异性；收集初发18例AML患者的外周血及骨髓样本，同时收集年龄和性别匹配的20例健康志愿者的样本作为对照，采用实时荧光定量PCR验证差异基因在AML患者体内的表达水平。结果生物信息数据分析显示，根据R语言计算出的NK2转录因子相关基因位点3（<italic>NKX2-3</italic>）的最佳截断值0.051进行生存分析，发现与低表达<italic>NKX2-3</italic>的AML初发患者相比，高表达<italic>NKX2-3</italic>的AML初发患者总体生存率较差（<italic>P </italic>= 0.003 6）；与HI相比，<italic>NKX2-3</italic>在AML初发组患者中显著高表达（<italic>P </italic>&lt; 0.001）；实时荧光定量PCR的验证结果也证实N<italic>KX2-3-1</italic>和<italic>NKX2-3-2</italic>在AML初发组患者中高表达，且与健康人组相比有显著相关性（<italic>P = </italic>0.000， <italic>P </italic>= 0.000）。结论<italic>NKX2-3</italic>在AML初发组患者中高表达，且高表达<italic>NKX2-3</italic>的AML患者总体生存较差；<italic>NKX2-3</italic>可能与AML临床转归与预后密切相关。
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institution Kabale University
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spelling doaj-art-1d289de3725b4adfb9d9d93e94f5c2eb2025-01-15T04:03:31ZzhoEditorial Office of Journal of Sun Yat-sen UniversityZhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban1672-35542024-01-0145636846977860急性髓系白血病新型预后分子标志物<italic>NKX2-3</italic>的发现王婉頔常桃江思远侯琪金真伊吴秀丽目的通过分析生物信息数据库中影响急性髓系白血病（AML）患者的预后的分子标志物的表达，为进一步探索AML预后的新型分子标志物提供实验基础。方法从癌症基因组图谱（TCGA）生物信息数据库中的179例AML患者的预后数据进行差异性基因分析及生存分析；利用基因表达集锦（GEO）数据库中的GSE13159数据集的74例健康人（HI）骨髓标本与542例AML初发患者骨髓标本进行分析，检测差异性目的基因表达水平在AML初发患者与健康人中的差异性；收集初发18例AML患者的外周血及骨髓样本，同时收集年龄和性别匹配的20例健康志愿者的样本作为对照，采用实时荧光定量PCR验证差异基因在AML患者体内的表达水平。结果生物信息数据分析显示，根据R语言计算出的NK2转录因子相关基因位点3（<italic>NKX2-3</italic>）的最佳截断值0.051进行生存分析，发现与低表达<italic>NKX2-3</italic>的AML初发患者相比，高表达<italic>NKX2-3</italic>的AML初发患者总体生存率较差（<italic>P </italic>= 0.003 6）；与HI相比，<italic>NKX2-3</italic>在AML初发组患者中显著高表达（<italic>P </italic>&lt; 0.001）；实时荧光定量PCR的验证结果也证实N<italic>KX2-3-1</italic>和<italic>NKX2-3-2</italic>在AML初发组患者中高表达，且与健康人组相比有显著相关性（<italic>P = </italic>0.000， <italic>P </italic>= 0.000）。结论<italic>NKX2-3</italic>在AML初发组患者中高表达，且高表达<italic>NKX2-3</italic>的AML患者总体生存较差；<italic>NKX2-3</italic>可能与AML临床转归与预后密切相关。http://xuebaoyx.sysu.edu.cn/zh/article/doi/10.13471/j.cnki.j.sun.yat-sen.univ(med.sci).20240004.014/急性髓系白血病<italic>NKX2-3</italic>生物信息学预后基因表达相关性
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