急性髓系白血病新型预后分子标志物<italic>NKX2-3</italic>的发现

急性髓系白血病新型预后分子标志物<italic>NKX2-3</italic>的发现

目的通过分析生物信息数据库中影响急性髓系白血病（AML）患者的预后的分子标志物的表达，为进一步探索AML预后的新型分子标志物提供实验基础。方法从癌症基因组图谱（TCGA）生物信息数据库中的179例AML患者的预后数据进行差异性基因分析及生存分析；利用基因表达集锦（GEO）数据库中的GSE13159数据集的74例健康人（HI）骨髓标本与542例AML初发患者骨髓标本进行分析，检测差异性目的基因表达水平在AML初发患者与健康人中的差异性；收集初发18例AML患者的外周血及骨髓样本，同时收集年龄和性别匹配的20例健康志愿者的样本作为对照，采用实时荧光定量PCR验证差异基因在AML患者体内的表达水平。...

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Main Authors: 王婉頔, 常桃, 江思远, 侯琪, 金真伊, 吴秀丽
Format: Article
Language:zho
Published: Editorial Office of Journal of Sun Yat-sen University 2024-01-01
Series:Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban
Subjects:
急性髓系白血病
<italic>NKX2-3</italic>
生物信息学
预后
基因表达
相关性
Online Access:http://xuebaoyx.sysu.edu.cn/zh/article/doi/10.13471/j.cnki.j.sun.yat-sen.univ(med.sci).20240004.014/
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Description
Summary:目的通过分析生物信息数据库中影响急性髓系白血病（AML）患者的预后的分子标志物的表达，为进一步探索AML预后的新型分子标志物提供实验基础。方法从癌症基因组图谱（TCGA）生物信息数据库中的179例AML患者的预后数据进行差异性基因分析及生存分析；利用基因表达集锦（GEO）数据库中的GSE13159数据集的74例健康人（HI）骨髓标本与542例AML初发患者骨髓标本进行分析，检测差异性目的基因表达水平在AML初发患者与健康人中的差异性；收集初发18例AML患者的外周血及骨髓样本，同时收集年龄和性别匹配的20例健康志愿者的样本作为对照，采用实时荧光定量PCR验证差异基因在AML患者体内的表达水平。结果生物信息数据分析显示，根据R语言计算出的NK2转录因子相关基因位点3（<italic>NKX2-3</italic>）的最佳截断值0.051进行生存分析，发现与低表达<italic>NKX2-3</italic>的AML初发患者相比，高表达<italic>NKX2-3</italic>的AML初发患者总体生存率较差（<italic>P </italic>= 0.003 6）；与HI相比，<italic>NKX2-3</italic>在AML初发组患者中显著高表达（<italic>P </italic>&lt; 0.001）；实时荧光定量PCR的验证结果也证实N<italic>KX2-3-1</italic>和<italic>NKX2-3-2</italic>在AML初发组患者中高表达，且与健康人组相比有显著相关性（<italic>P = </italic>0.000， <italic>P </italic>= 0.000）。结论<italic>NKX2-3</italic>在AML初发组患者中高表达，且高表达<italic>NKX2-3</italic>的AML患者总体生存较差；<italic>NKX2-3</italic>可能与AML临床转归与预后密切相关。
ISSN:1672-3554

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